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Enregistrement W4405264413 · doi:10.33696/neurol.5.103

Protein Assembly Modulation: A New Approach to Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) Therapeutics

2024· article· en· W4405264413 sur OpenAlexaff
Shao Feng Yu, Kumar Paulvannan, Dennis Solas, Anuradha F. Lingappa, Ana Raquel Moreira, Shriya Sahu, Maya Michon, Amanda Macieik, Danielle Goldsmith, Nicholas DeYarman, Suguna Mallesh, M. Dharma Prasad, Claudia Maios, Kai Ruan, Giulio Srubek Tomassy, Elizabeth H. Jensen, Emma McGuirk, Verian Bader, Andreas Mueller-Schiffmann, Jonathan C. Reed, Jaisri R. Lingappa, Vinod Asundi, Shi Hong, Steve Jacobsen, Nicholas J. Brandon, Lyle W. Ostrow, Tom Lloyd, J. Alex Parker, Kim A. Staats, Justin K. Ichida, James C. Dodge, Debendranath Dey, Carsten Korth, Suganya Selvarajah, Vishwanath R. Lingappa, Jeffrey Rosenfeld

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Neurology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeCongressionally Directed Medical Research ProgramsNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthTarget ALSU.S. Department of Defense
Mots-clésAmyotrophic lateral sclerosisInteractomeBiologyDrug discoveryCell biologyComputational biologyGeneNeuroscienceDiseaseGeneticsBioinformaticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a devastating and progressive neurodegenerative disease with a complex, multifactorial pathophysiology, culminating in death of motor neurons. We introduce a new mechanism of ALS pathogenesis via study of a novel drug-like small molecule series that targets a subset of protein disulfide isomerase (PDI) within a previously largely unappreciated transient and energy-dependent multi-protein complex enriched for proteins of the ALS interactome. This drug, found by a novel phenotypic screen, has activity in cellular models for both familial and sporadic ALS, as well as in transgenic worms, flies, and mice bearing a diversity of human genes with ALS-associated mutations. The hit compound was initially identified as a modulator of human immunodeficiency virus (HIV) capsid assembly in cell-free protein synthesis and assembly (CFPSA) systems, with demonstrated antiviral activity against infectious HIV in cell culture. Its advancement for ALS-therapeutics, subsequent separation of activity against HIV and ALS into separate chemical subseries through structure-activity-relationship (SAR) optimization, and identification of the drug target by affinity chromatography as shown here, may provide insights into the molecular mechanisms governing pathophysiology of disordered homeostasis relevant to ALS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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