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Enregistrement W4405300018 · doi:10.1016/j.celrep.2024.115080

SARS-CoV-2 3CLpro (main protease) regulates caspase activation of gasdermin-D/E pores leading to secretion and extracellular activity of 3CLpro

2024· article· en· W4405300018 sur OpenAlexafffund
Peter M. Grin, Kaushal Baid, Hugo César Ramos de Jesus, Nedim Kozarac, Peter A. Bell, Steven Z. Jiang, Reinhild Kappelhoff, Georgina S. Butler, Nathan Georges François Leborgne, Christina L. Pan, Isabel Pablos, Yoan Machado, John C. Vederas, Hugh Kim, Charaf Benarafa, Arinjay Banerjee, Christopher M. Overall

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of SaskatchewanVancouver Hospital and Health Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of British ColumbiaCanada Research ChairsCanada Foundation for InnovationArthritis SocietySchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungCentre for Blood Research, University of British ColumbiaMichael Smith Health Research BCNational Science Foundation
Mots-clésExtracellularSecretionCell biologyProteaseChemistryIntracellularBiologyEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SARS-CoV-2 3C-like protease (3CL pro or M pro ) cleaves the SARS-CoV-2 polyprotein and >300 intracellular host proteins to enhance viral replication. By lytic cell death following gasdermin (GSDM) pore formation in cell membranes, antiviral pyroptosis decreases 3CL pro expression and viral replication. Unexpectedly, 3CL pro and nucleocapsid proteins undergo unconventional secretion from infected cells via caspase-activated GSDMD/E pores in the absence of cell lysis. Bronchoalveolar lavage fluid of wild-type SARS-CoV-2-infected mice contains 3CL pro , which decreases in Gsdmd −/− Gsdme −/− mice. We identify new 3CL pro cut-sites in GSDMD at LQ 29 ↓ 30 SS, which blocks pore formation by 3CL pro cleavage at LH 270 ↓N lying adjacent to the caspase activation site (NFLTD 275 ↓G). Cleavage inactivation of GSDMD prevents excessive pore formation, thus countering antiviral pyroptosis and increasing 3CL pro secretion. Extracellular 3CL pro retains activity in serum, dampens platelet activation and aggregation, and inactivates antiviral interferon-λ1. Thus, in countering gasdermin pore formation and pyroptosis in SARS-CoV-2 infection, 3CL pro is secreted with extracellular pathological sequelae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,582

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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