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Enregistrement W4405307880 · doi:10.1101/2024.12.10.24318788

Investigating the pathogenicity of the recessive <i>HNF1A</i> p.A251T variant in monogenic diabetes using iPSC-derived beta-like cells

2024· preprint· en· W4405307880 sur OpenAlexafffund
Ines Cherkaoui, Qian Du, Dieter Egli, Camille Dion, Harry G. Leitch, Dilshad Sachedina, Shivani Misra, Guy A. Rutter

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthImperial College LondonDiabetes UKWellcome Trust
Mots-clésHNF1AInduced pluripotent stem cellMaturity onset diabetes of the youngBiologyDiabetes mellitusMutationGeneticsGeneBETA (programming language)InsulinPhenotypeEndocrinologyCancer researchEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Monogenic diabetes, formerly called Maturity-Onset Diabetes of the Young (MODY), involves single-gene mutations, typically with dominant inheritance, and has been associated with variants in 14 genes. Among these, HNF1A mutations are the most common, and their diagnosis allows the use of alternative therapies, including sulfonylureas. In an earlier study, we described a variant displaying recessive transmission, p.A251T (Misra, S et al, Diabetes Care , 2020). Initial functional studies revealed only a modest impact on protein function. We extend these earlier in vitro studies to demonstrate that beta-like cells derived from pluripotent stem cells from variant carriers show impaired differentiation into insulin-positive cells, whereas differentiation into alpha cells is significantly enhanced. Additionally, mutant cells showed impaired glucose-stimulated insulin secretion but partially preserved responsiveness to treatment with sulfonylureas. Our study provides proof of principle for the utility of using patient-derived stem cells as a platform to assess the pathogenicity of HNF1A variants, and to explore potential treatment strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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