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Enregistrement W4405311405 · doi:10.1016/j.jare.2024.11.034

Soybean nodulation shapes the rhizosphere microbiome to increase rapeseed yield

2024· article· en· W4405311405 sur OpenAlexaff
Yü Liu, Qin Han, Jiaming Zhang, Xuehai Zhang, Yuqin Chen, Mingbo Li, Yongfang Hao, Yujie Hong, Ruizhen Tang, Brett J. Ferguson, Peter M. Gresshoff, Jie Kuai, Guangsheng Zhou, Xia Li, Hongtao Ji

Notice bibliographique

RevueJournal of Advanced Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesScience and Technology Program of Hubei ProvinceNational Key Research and Development Program of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésRhizosphereRapeseedCrop rotationAgricultureAgronomyCropCrop productivityNitrogen fixationYield (engineering)ProductivityEnvironmental scienceRotation systemMicrobiomeCrop yieldBiologyAgroforestryBacteriaNitrogenEcologyChemistryEconomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

• Decoding Soybean Root Secretions: By analyzing secretions within the soybean root secretome across three different soybean nodulation genotypes with the same background, we discovered that supernodulating soybeans secrete higher levels of fatty acids and carbohydrates. • Bacterial Communities Clarification: Investigating the rhizosphere bacterial communities of soybeans with varying nodulation patterns in central China, we identified Sphingomonadaceae as the predominant rhizosphere bacteria associated with soybean nodulation capacity. • Metabolites and Bacterial Attraction: The soybean root secretes a metabolite called cis -4-hydroxy-D-proline, which attracts the accumulation of Sphingomonadaceae species in the soybean rhizosphere. Furthermore, oleic acid and cis -4-hydroxy-D-proline provide essential carbon nutrients for the growth of Sphingomonadaceae species. • Promoting Oilseed Growth: Exogenous application of Sphingomonadaceae bacteria, either alone or in combination with rhizobia, can effectively promote subsequent rapeseed growth. • These findings elucidate the role of soybean nodulation in rhizosphere bacterial dynamics, highlighting its importance in sustainable agricultural practices. Crop rotation, a crucial agricultural practice that enhances soil health and crop productivity, is widely used in agriculture worldwide. Soybeans play a crucial role in crop rotation owing to their nitrogen-fixing ability, which is facilitated by symbiotic bacteria in their root systems. The soybean-rapeseed rotation is an effective agricultural practice in the Yangtze River Basin of China. However, the mechanism underlying the effectiveness of this system remains unknown. The aim of this study was to decipher the mechanisms by which previous soybean cultivation enhances the growth of subsequent rapeseed. Soybeans with three distinct nodulation genotypes were rotated with rapeseed, and the impact of previous soybean cultivation on subsequent rapeseed growth was evaluated by examining the soybean root secretome and soil rhizosphere microbiome. Soybean-rapeseed rotation significantly enhanced subsequent rapeseed growth and yield, especially when supernodulating soybean plants were used, which released the most nitrogen into the soil rhizosphere. The differences in soybean nodulation capability led to variations in root exudation, which in turn influenced the bacterial communities in the rhizosphere. Notably, the supernodulating soybean plants promoted Sphingomonadaceae family of bacteria growth by secreting oleic acid and cis -4-hydroxy-D-proline, and further attracted them through cis -4-hydroxy-D-proline. Furthermore, the exogenous application of Sphingomonadaceae bacteria, either alone or in combination with rhizobia, significantly enhanced the growth of rapeseed. Our data definitively demonstrated the crucial role of previous soybean cultivation in enhancing the yield of rapeseed, with the assistance of Sphingomonadaceae bacteria and rhizobia. This study elucidates the role of soybean nodulation in rhizosphere bacterial dynamics, highlighting its importance in sustainable agricultural practices.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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