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Enregistrement W4405322665 · doi:10.1097/tp.0000000000005279

A Risk Score Using a Cell-based Assay Predicts Long-term Over-immunosuppression Events in Kidney Transplant Recipients

2024· article· en· W4405322665 sur OpenAlexafffund
Olivier Désy, Marie-Pier Thivierge, Stéphanie Béland, Jean-Simon Desgagnés, François Bouchard-Boivin, Alcino Gama, Isabelle Houde, Isabelle Lapointe, Isabelle Côté, Julie Lesage, Sacha A. De Serres

Notice bibliographique

RevueTransplantation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesKidney Foundation of Canada
Mots-clésImmunosuppressionPeripheral blood mononuclear cellMedicineCD14Internal medicineFramingham Risk ScorePercentileOncologyImmunologyRenal functionImmune systemBiologyIn vitroDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Infections and cancer are major causes of premature death in organ recipients. However, there have been few advances in personalized immunosuppressive therapy. We previously reported that a cell-based assay measuring CD14 + 16 + tumor necrosis factor-α + monocytes after peripheral blood mononuclear cell (PBMC) incubation with Epstein-Barr virus peptides has a high sensitivity for detecting over-immunosuppression (OIS) events in kidney recipients in the short term. We aimed to develop a risk score for predicting long-term events. METHODS: We studied 551 PBMC samples from 118 kidney recipients. Following random allocation to a testing and training set, we derived a risk function for the delineated tertiles of low, intermediate, and high risk of OIS based on age and CD14 + 16 + tumor necrosis factor-α + cells. RESULTS: Patients were followed for a median of 6.3 y (25th-75th percentiles: 3.7-8.3 y). Of these, 40 (34%) experienced an OIS event. The validation indicated that the risk score was well calibrated, with an absolute risk of 21%, 41%, and 61% in the low-, intermediate-, and high-risk categories, respectively ( P = 0.03). In sensitivity analyses, the risk score was robust to alternative definitions of OIS ranging from mild to severe. In particular, when restricted to life-threatening OIS, the proportion of events varied from 5% to 27% among the low- and high-risk categories, respectively ( P = 0.01). CONCLUSIONS: Using a combination of age and in vitro PBMC response to Epstein-Barr virus peptides allows a substantial shift in the estimated risk of OIS events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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