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Enregistrement W4405338663 · doi:10.3389/fgene.2024.1467404

Behind the scenes with genomics researchers

2024· article· en· W4405338663 sur OpenAlexafffund
Lori Bradford, Cheryl Buckmaster, Graham Strickert, Jason MacLean, Diane Dupont

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Bioinformatics, and Biomedical Research
Établissements canadiensBrock UniversityUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesGenome Canada
Mots-clésGenomicsThematic analysisEngineering ethicsDisciplinePublishingData sciencePsychologySociologyQualitative researchPolitical scienceSocial scienceComputer scienceBiologyEngineeringGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although lab-coat genomics scientists are highly skilled and involved in pioneering work, few studies have examined their perceptions on what they do, and how they relate with others in interdisciplinary work. Recognizing that gap, we were curious to talk with scientists about their current work and positionalities related to the use of genomics for bioremediation. Using unstructured open-ended interviews and thematic analysis, we interviewed researchers with diverse genomics-related expertise. Emerging topics were grouped into two broad categories akin to Bronfenbrenner's nested developmental model: microsystem matters, comprising technical advances, barriers, and localized concerns; and macrosystem matters, exploring wider reflections and the philosophies of genomics and society. At the microsystem level, findings revealed differences of opinion about methodological steps, but there was agreement about the incompleteness of databases and the absence of established reference values. These two problems may not only impact a project's progress but also the ability to gauge success, affecting budgeting, human resource needs, and overall stress. At the macrosystem level, scientists voiced concerns about how different social groups perceive and accept genomics applications, as those tend to be viewed by lay persons as genetic interventions. Another focus was on how academic publication slows progress because it is orientated toward positive results while gaps in knowledge could be filled by publishing negative results or methodological barriers. This study underscores scientists' self-awareness within the genomics discipline, acknowledging how their beliefs and biases shape research outcomes. It illuminates critical reflections essential for navigating societal and scientific landscapes in genomics research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,590
Score d'incertitude au seuil0,472

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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