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Enregistrement W4405365135 · doi:10.1371/journal.pdig.0000692

Classification of periodontitis stage and grade using natural language processing techniques

2024· article· en· W4405365135 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLOS Digital Health · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueDental Radiography and Imaging
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta InnovatesUniversity of Alberta
Mots-clésPeriodontitisArtificial intelligenceComputer scienceStage (stratigraphy)PreprocessorData pre-processingMachine learningPattern recognition (psychology)Natural language processingMedicineDentistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Periodontitis is a complex and microbiome-related inflammatory condition impacting dental supporting tissues. Emphasizing the potential of Clinical Decision Support Systems (CDSS), this study aims to facilitate early diagnosis of periodontitis by extracting patients' information collected as dental charts and notes. We developed a CDSS to predict the stage and grade of periodontitis using natural language processing (NLP) techniques including bidirectional encoder representation for transformers (BERT). We compared the performance of BERT with that of a baseline feature-engineered model. A secondary data analysis was conducted using 309 anonymized patient periodontal charts and corresponding clinician's notes obtained from the university periodontal clinic. After data preprocessing, we added a classification layer on top of the pre-trained BERT model to classify the clinical notes into their corresponding stage and grades. Then, we fine-tuned the pre-trained BERT model on 70% of our data. The performance of the model was evaluated on 32 unseen new patients' clinical notes. The results were compared with the output of a baseline feature-engineered algorithm coupled with MLP techniques to classify the stage and grade of periodontitis. Our proposed BERT model predicted the patients' stage and grade with 77% and 75% accuracy, respectively. MLP model showed that the accuracy of correct classification of stage and grade of the periodontitis on a set of 32 new unseen data was 59.4% and 62.5%, respectively. The BERT model could predict the periodontitis stage and grade on the same new dataset with higher accuracy (66% and 72%, respectively). The utilization of BERT in this context represents a groundbreaking application in dentistry, particularly in CDSS. Our BERT model outperformed baseline models, even with reduced information, promising efficient review of patient notes. This integration of advanced NLP techniques with CDSS frameworks holds potential for timely interventions, preventing complications and reducing healthcare costs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,874
Score d'incertitude au seuil0,368

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle