Polyphosphate as a Novel Regulator of Super-Enhancer Complexes: Disruption of Phase Separation and Gene Expression
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Inorganic polyphosphate (polyP) is a highly conserved linear polymer of orthophosphate, present across nearly all living organisms. Its functional diversity, particularly through recently discovered post-translational modifications, has garnered increasing scientific interest. However, its role in gene regulation, especially in mammalian systems, remains unexplored. In this study, we present findings that demonstrate that polyP multi-targets the super-enhancer complex to regulate gene expression, marking a novel mechanism of transcriptional control. We show that polyP modifies key components of the complex, including the Mediator subunit MED1, the coactivator Bromodomain-containing protein 4 (BRD4), and the transcriptional regulator Yin Yang 1 (YY1). This polyP-mediated modification not only disrupts their ability to undergo phase separation but also downregulates the expression of MED1 and BRD4, as well as impairs the nuclear localization of YY1. Furthermore, polyP inhibits YY1 dimer formation and disrupts YY1-mediated DNA looping, leading to suppressed gene expression. These discoveries highlight polyP as a novel regulator of super-enhancer-driven gene transcription and provide new insights into the broader role of polyP in epigenetic regulation. This work uncovers a previously unknown layer of gene control, positioning polyP as a critical player in transcriptional regulation through its interaction with transcription factors and coactivators.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».