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Enregistrement W4405400559 · doi:10.1111/eci.14350

Mechanism and function of <scp>CEACAM1</scp> splice isoforms

2024· review· en· W4405400559 sur OpenAlexaff
Kenneth J. Dery, Sonia M. Najjar, Nicole Beauchemin, John E. Shively, Jerzy W. Kupiec‐Weglinski

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Clinical Investigation · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiopharmaceutical Chemistry and Applications
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésAlternative splicingCell biologyRNA splicingBiologySignal transductionExonEctodomainGene isoformRNAGeneticsGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Alternative splicing is a fundamental mechanism in the post-transcriptional regulation of genes. The multifunctional transmembrane glycoprotein receptor carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1 (CEACAM1) undergoes extensive alternative splicing to allow for tunable functions in cell signalling, adhesion and modulation of immune and metabolic responses. Splice isoforms that differ in their ectodomain and short or long cytoplasmic tail (CEACAM1-S/CEACAM1-L) have distinct functional roles. The mechanisms that regulate CEACAM1 RNA splicing remain elusive. METHODS: This narrative review summarizes the current knowledge of the mechanism and function of CEACAM1 splice isoforms. Historical perspectives address the biological significance of the glycosylated Ig domains, the variable exon 7, and phosphorylation events that dictate its signal transduction pathways. The use of small antisense molecules to target mis-spliced variable exon 7 is discussed. RESULTS: The Ig variable-like N domain mediates cell adhesion and immune checkpoint inhibitory functions. Gly and Tyr residues in the transmembrane (TM) domain are essential for dimerization. Calmodulin, Calcium/Calmodulin-dependent protein kinase II delta (CamK2D), Actin and Annexin A2 are binding partners of CEACAM1-S. Homology studies of the muCEACAM1-S and huCEACAM1-S TM predict differences in their signal transduction pathways. Hypoxia-inducible factor 1-α (HIF-1-α) induces alternative splicing to produce CEACAM1-S under limited oxygen conditions. Antisense small molecules directed to exon 7 may correct faulty expression of the short and long cytoplasmic tail splicing isoforms. CONCLUSION: More pre-clinical and clinical studies are needed to elucidate the precise mechanisms by which CEACAM1 RNA splicing may be exploited to develop targeted interventions towards novel therapeutic strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,967
Score d'incertitude au seuil0,720

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,215
Tête enseignante GPT0,442
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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