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Enregistrement W4405410079 · doi:10.1111/jgh.16846

Postcholecystectomy Gut Microbiome Changes and the Clinical Impact: A Systematic Review With Narrative Synthesis

2024· review· en· W4405410079 sur OpenAlexaboutno aff
Tiing Leong Ang, Seok Hwee Koo, Daphne Ang, Chin Kimg Tan, Lai Mun Wang, Sunny H. Wong, Pierce K. H. Chow

Notice bibliographique

RevueJournal of Gastroenterology and Hepatology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrevotellaFirmicutesDysbiosisFusobacteriaBacteroidesMicrobiomeGastroenterologyGut floraMedicineInternal medicineBifidobacteriumMicrobiologyPhysiologyBiologyImmunologyBioinformaticsLactobacillusGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cholecystectomy (CCE) can affect the enterohepatic circulation of bile acids and result in gut microbiome changes. This systematic review aimed to clarify the effect of CCE on gut microbiome composition and its clinical impact. METHOD: A systematic search was conducted in PubMed, Web of Science, and Scopus, combining keywords such as "cholecystectomy" or "post-cholecystectomy" with "gut microbiome," "stool microbiome," or "gut dysbiosis." Data were extracted and synthesized using narrative review. Study quality was assessed using the Newcastle-Ottawa scale. RESULTS: A total of 1373 articles were screened and 14 studies were selected. Significant but inconsistent microbiome changes were reported. Changes were observed in alpha and beta diversity. At phylum level, an increase in Bacteroides and Ascomycota, decrease in Firmicutes, Actinomycetes, and Basidiomycota, and both increase and decrease in Fusobacteria were reported. At genus level, an increase in Prevotella and a decrease in Faecalibacterium were reported. In post-CCE diarrhea, decreased beta diversity, a decreased F/B ratio, an increase in Prevotella, an increase in Phocaeicola vulgatus, and a decrease in Prevotella copri were noted. For post-CCE syndrome, a higher abundance of Proteobacteria and decreased Firmicutes/Bacteroides (F/B) ratio were reported. A decreased relative abundance of Bifidobacterium longum subsp. longum from controls to CCE without colonic neoplasia to CCE with colonic neoplasia, and an increased abundance of Candida glabrata from controls, to CCE without colonic neoplasia and CCE with colonic neoplasia, were reported. CONCLUSION: Patients who underwent CCE had significant gut dysbiosis. However, current studies could not clarify the detailed gut microbial structural and functional changes associated with CCE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,049
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,052

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,049
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,007
Bibliométrie0,0100,010
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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