Staphylococci and mammaliicocci: Which species are important for udder health on organic dairy farms?
Notice bibliographique
Résumé
Variation in species distribution and diversity of staphylococci and mammaliicocci (SaM) causing intramammary infections in dairy cattle is associated with different management practices. Disparate selective pressures on organic dairies could potentially result in population differences of these mastitis-causing bacteria. The species-specific effect on quarter SCC of SaM for a population of certified organic dairies has not been described previously. The current study presents data from a longitudinal study of 10 certified organic dairy farms. The objective was to estimate how quarter milk somatic cell count (qmSCC) varied as a result of infection with the most frequently isolated SaM species. Aerobic culture of quarter milk samples to identify IMI was conducted in parallel with determination of qmSCC. A linear hierarchical repeated measures mixed model was used to estimate qmSCC for quarters with an IMI caused by a given SaM species, compared with culture-negative quarters. The model included DIM at time of sampling to adjust qmSCC estimates for each SaM species. The final dataset consisted of 648 quarters with an IMI due to 10 different SaM species and 1,972 culture-negative quarters. Staphylococcus chromogenes was the most frequent species, followed by S. aureus, S. haemolyticus, and S. simulans. A large amount of variability was observed in the SCS for culture-negative quarters and those infected with many SaM species, especially S. chromogenes, S. haemolyticus, S. simulans, and S. aureus. Somatic cell score was significantly higher in quarters infected with S. agnetis, S. aureus, S. chromogenes, S. devriesei, S. haemolyticus, S. hyicus, S. simulans, S. warneri, and S. xylosus compared with culture-negative quarters. The highest cell count was for quarters infected with S. warneri, followed by S. aureus, S. agnetis, and S. hyicus. The relative distribution of various SaM species and their effect on qmSCC in this population of small to midsize organic farms was similar to previous studies. Although the increase in qmSCC was modest for most SaM species observed, the widespread prevalence of these intramammary pathogens could potentially contribute to sizable increases in bulk tank SCC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».