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Enregistrement W4405444871 · doi:10.1084/jem.20241413

A common form of dominant human IFNAR1 deficiency impairs IFN-α and -ω but not IFN-β-dependent immunity

2024· article· en· W4405444871 sur OpenAlexaff
Fahd Al Qureshah, Jérémie Le Pen, Nicole A. de Weerd, Marcela Moncada‐Vélez, Marie Materna, Daniel Chieh-Ding Lin, Fernanda Sales Luiz Vianna, Lucy Bizien, Lazaro Lorenzo, Marc Lecuit, Jean‐David Pommier, Sevgi Keleş, Tayfun Özçelık, Sigifredo Pedraza‐Sánchez, Nicolas de Prost, Loubna El Zein, Hassan Hammoud, Lisa F. P. Ng, Rabih Halwani, Narjes Saheb Sharif‐Askari, YL Lau, Anthony Raymond Tam, Neha Singh, Sagar Bhattad, Yackov Berkun, Wasun Chantratita, Raúl Aguilar-López, Mohammad Shahrooei, Laurent Abel, Alessandro Aiuti, Saleh Al‐Muhsen, Ana Bertha Alcántara-Garduño, Evangelos Andreakos, Andrés A. Arias, Hagit Baris Feldman, Paul Bastard, Alexandre Bolze, A. Borghesi, Ahmed Aziz Bousfiha, Petter Brodin, John Christodoulou, Aurélie Cobat, Roger Colobrán, Antonio Condino-Neto, Sotiriјa Duvlis, Xavier Duval, Munis Dündar, Soha Fakhreddine, Jacques Fellay, Carlos Flores, José Luis Barrera Franco, Guy Gorochov, Peter K. Gregersen, David Hagin, María Teresa Herrera, Ivan Fan-Ngai Hung, Emmanuelle Jouanguy, Daniel Leung, Tom Le-voyer, Davood Mansouri, Jesús Mercado-García, Isabelle Meyts, Trine H. Mogensen, Antonio Novelli, Giuseppe Novelli, Satoshi Okada, Fırat Özçelik, Rebeca Pérez de Diego, Jordi Pérez‐Tur, Graziano Pesole, Anne Puel, Laurent Rénia, Igor Resnick, Carlos Rodríguez‐Gallego, Manal Sbeity, Sahar Sedighzadeh, Pere Soler‐Palacín, András N. Spaan, Stuart G. Tangye, Ahmad Abou Tayoun, Şehime Gülsün Temel, Christian Thorball, Ibrahim Torktaz, Sophie Trouillet‐Assant, Stuart E. Turvey, K. M. Furkan Uddin, Donald C. Vinh, Oscar Zabaleta-Martínez, Qian Zhang, Shen‐Ying Zhang, Jean‐Laurent Casanova, Chanreaksmey Eng, Kimrong Bun, MengHeng Oum, Patrice Piola, Arnaud Tarantola, Mey Channa, Veasna Duong, Philippe Buchy, Chris Gorman, Yoann Crabol, Philippe Dussart, M. Bunleat, M. Panha, Malcolm Sim, Em Bunnakea, Denis Laurent, Sothy Heng, Ky Santy, Anousone Douangnouvong, Danoy Chommanam, Khansoudaphone Phakhounthong, Manivanh Vongsouvath, Malee Seephone, Bountoy Sibounheunang, Sayaphet Rattanavong, Viengmon Davong, Malavanh Vongsouvath, Mayfong Mayxay, Audrey Dubot‐Pérès, Paul N. Newton, Sommanikhone Phangmanixay, Khounthavy Phongsavath, Đặng Đức Anh, Do Quyen, Tran Thi Mai Hung, Nguyễn Thị Thu Thủy, Luong Minh Tan, Anh Tuấn Thanh Phạm, Nguyễn Trần Hiển, Do Thu Huong, Lê Thanh Hải, Nguyễn Văn Lâm, Phạm Nhật An, Phan Hữu Phúc, Phung Bich Thuy, Trần Thị Thu Hương, Chaw Su Hlaing, Aye Mya Min Aye, Cho Thair, Kyaw Linn, May July, Win Thein, Latt Latt Kyaw, Htay Htay Tin, Ommar Swe Tin, Khin Yi Oo, Magali Herrant, Magali Lago, Maud Seguy, Marc Jouan, Lukas Hafner, Philippe Pérot, Marc Éloit, Olivier Lortholary, Julien Capelle, Bruno Rosset, Véronique Chevalier, Jérôme Honnorat, Anne Laurie Pinto, Xavier de Lamballerie, Kevin Bleakley, Bernadette Murgue, Catherine Ferrant, Christian Devaux, Hervé Tissot‐Dupont, Jean‐Paul Moatti, Pascal Bonnet, Didier Fontenille, Jean-François Delfraissy, Patrice Debré, Vivien Béziat, Peng Zhang, Charles M. Rice, Paul J. Hertzog

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensASTERSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNIH Clinical CenterNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesFisher Center for Alzheimer's Research FoundationAgence Nationale de la RechercheNational Center for Research ResourcesKing Abdulaziz City for Science and TechnologyStavros Niarchos FoundationKing Abdullah University of Science and TechnologyNational Center for Advancing Translational SciencesKing Saud UniversitySCOR Corporate Foundation for ScienceInstitut des maladies génétiques ImagineKarolinska InstitutetInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleUniversity of Texas Southwestern Medical CenterFondation du SouffleWellcome TrustMeyer FoundationRockefeller UniversityNational Institutes of HealthAmerican Lung AssociationSt. Giles FoundationConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoInstitut de Recherche pour le DéveloppementHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyAlleleDominance (genetics)HaploinsufficiencyGeneticsInterferonImmunityImmunologyPhenotypeHeterozygote advantageGeneImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autosomal recessive deficiency of the IFNAR1 or IFNAR2 chain of the human type I IFN receptor abolishes cellular responses to IFN-α, -β, and -ω, underlies severe viral diseases, and is globally very rare, except for IFNAR1 and IFNAR2 deficiency in Western Polynesia and the Arctic, respectively. We report 11 human IFNAR1 alleles, the products of which impair but do not abolish responses to IFN-α and -ω without affecting responses to IFN-β. Ten of these alleles are rare in all populations studied, but the remaining allele (P335del) is common in Southern China (minor allele frequency ≈2%). Cells heterozygous for these variants display a dominant phenotype in vitro with impaired responses to IFN-α and -ω, but not -β, and viral susceptibility. Negative dominance, rather than haploinsufficiency, accounts for this dominance. Patients heterozygous for these variants are prone to viral diseases, attesting to both the dominance of these variants clinically and the importance of IFN-α and -ω for protective immunity against some viruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,610

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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