MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405445489 · doi:10.26685/urncst.707

A Tibetan Allele of EPAS1 as a Model for Investigating the Role of HIF-2α in Ewing Sarcoma

2024· article· en· W4405445489 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlleleSarcomaEwing's sarcomaGeneticsBiologyMedicineGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypoxia is a hallmark symptom of solid tumors, including Ewing Sarcoma (EwS), which promotes tumor progression through a variety of complex biochemical and genetic pathways. The development of hypoxic tissues in tumors activates hypoxia inducible factors (HIF) which are believed to increase therapy resistance and metastasis. Endothelial Per-Arnt-Sim (PAS) domain-containing protein 1 (EPAS1) is known to encode an understudied HIF subunit called HIF-2α which may be a potential target for future therapies. A Tibetan population living in the Himalayan belt at high altitude has been shown to possess a Denisovan variation of the EPAS1 gene with reduced expression that contributes to their population’s hypoxia resistance. The relationship between thriving under hypoxic conditions and reduced expression of EPAS1 suggests this gene may be significantly involved in progressing hypoxic cancers. The objective of this study is to investigate the function of the EPAS1 gene under hypoxic conditions and its role in promoting cancer using the Tibetan allele as a convenient model for reduced expression. Three phases of experiments investigating tumor growth, therapy resistance, and metastasis will be performed using spheroid models and scratch wound analysis on EwS cells transfected with the Tibetan allele of EPAS1 (EPAS1t). It is expected that reduced EPAS1 expression will correlate to increased tumor growth, therapy resistance, and cell migration. These results would highlight EPAS1, and consequentially HIF-2α, as a biomarker for patient prognosis and a potential target for future therapies. Future studies may wish to expand this experiment by repeating the study with alternative cell lines, using animal models, or investigating the impacts of upregulated EPAS1 in hypoxic tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,356 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) JournalMême sujetCancer, Hypoxia, and MetabolismTravaux en français237 207