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Enregistrement W4405458820 · doi:10.3390/biom14121612

UPLC-MS/MS High-Risk Screening for Sphingolipidoses Using Dried Urine Spots

2024· article· en· W4405458820 sur OpenAlexaff
Tristan Martineau, Bruno Maranda, Christiane Auray‐Blais

Notice bibliographique

RevueBiomolecules · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesSanofi
Mots-clésChromatographyUrineMultiplexTandem mass spectrometryMedicineUrinary systemSolid phase extractionHigh-performance liquid chromatographyMass spectrometryChemistryInternal medicineBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Early detection of sphingolipidoses is crucial to prevent irreversible complications and improve patient outcomes. The use of urine samples dried on filter paper (DUS) is a non-invasive strategy that simplifies the collection, storage, and shipping of samples compared to using liquid urine specimens. Objectives: (1) Develop and validate a multiplex ultra-performance liquid chromatography–tandem mass spectrometry (UPLC-MS/MS) methodology using DUS to quantify twenty-one lysosphingolipids normalized to creatinine for eight different sphingolipidoses. (2) Establish normal reference values to evaluate the clinical utility of the methodology. Methods: Samples were eluted from a 5 cm filter paper disk (~1 mL of urine) and extracted on Oasis MCX solid-phase extraction cartridges prior to injection in the UPLC-MS/MS system. Results: Urinary lysosphingolipids were stable on DUS at −80 °C and −30 °C for 117 days, at 21.5 °C and 4 °C for at least 26 days, and at 35 °C for 3 days. Globotriaosylsphingosine, glucosylsphingosine, and their analogs were elevated in patients with Fabry disease and Gaucher disease, respectively, compared to controls (p-value < 0.0001). The analysis of related analog profiles suggests a better overall reliability in detecting patients early, especially for Fabry patients. Conclusions: This approach is feasible and might be useful for the early detection, monitoring, and follow-up of patients with sphingolipidoses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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