Phenotypic and Genomic Signatures of Latitudinal Local Adaptation Along With Prevailing Ocean Current in a Coastal Goby
Notice bibliographique
Résumé
In the marine realm, unidirectional ocean currents often lead to high migration rates of marine organisms and, therefore, inhibit the formation of their latitudinal genetic structure. In contrast, cryptic latitudinal structures associated with local adaptation may frequently exist in widespread species generally exposed to a strong environmental heterogeneity. However, our understanding of the evolvability of locally adapted populations in open marine environments still needs to be completed. The coastal area along the Sea of Japan, where the Tsushima Warm Current flows from south to north in the Japanese Archipelago, provides a good model system for exploring this question. This study explored evidence for latitudinal local adaptation along with the prevailing ocean current in the ice goby Leucopsarion petersii at the phenotypic and genomic levels. Common garden experiments clearly showed genetically based clinal variation in growth rate, strongly suggesting local adaptation through conutergradient selection of this fitness-related trait. Analyses based on reduced-representation sequencing revealed a slight signal of genetic differentiation between the southern and northern populations, although continuous historical gene flow between them was supported by demographic modelling. Also, whole-genome resequencing showed their independent demographic history during the last glacial period. Thus, these results suggest that gene flow along with the prevailing ocean current is somewhat limited, and the populations are not completely panmictic. Furthermore, the selection scan based on low-coverage genome-wide sequencing detected putative genomic signatures of latitudinal adaptation of growth-related genes. Thus, our integrative study provided a novel example of marine local adaptation under a large ocean current.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».