Ischemia-induced expression status of cofilin 1, CRSP2, HSP90, HSP27, and IL8 in epicardial adipose tissue and single cell transcriptomic profiling of stromal cells
Notice bibliographique
Résumé
Epicardial adipose tissue (EAT) is a rich source of EAT-derived stromal cells (EATDS), which possess regenerative potential. CRSP2, HSP27, IL8, HSP90, and Cofilin 1 were detected in the secretome of left ventricular stromal cells under ischemia challenge. However, the association of these genes in the EAT and EATDS remain understudied. We aim to assess the status of cofilin 1, CRSP2, HSP27, IL8, and HSP90 in the EAT of myocardial infarction (MI) and coronary artery bypass graft (CABG) swine models and in vitro stimulated ischemic EATDS. Expression status of these proteins in EAT were assessed by immunostaining, and in EATDS using qRT-PCR, immunostaining, and Western blot. EATDS phenotyping was performed using sc-RNAseq analysis. Cofilin 1 was increased while the other four genes were decreased in the CABG. IL8 and HSP90 were increased, while CRSP2, HSP27, and cofilin 1 were decreased in the MI group. Similar trend was displayed in the expression of these genes in EATDS. Additionally, EATDS displayed versatile phenotypes at single cell resolution based on the differential expression of various gene signatures. The findings revealed novel insights into EAT/EATDS biology and further understanding regarding the EATDS sub-phenotypes would open novel avenues in translational cardiology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».