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Enregistrement W4405489389 · doi:10.1109/embc53108.2024.10782494

Semantic AutoSAM: Self-Prompting Segment Anything Model for Semantic Segmentation of Medical Images

2024· article· en· W4405489389 sur OpenAlexafffund
Assefa Seyoum Wahd, Jessica Küpper, Jacob L. Jaremko, Abhilash Rakkunedeth Hareendranathan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE HealthAlberta Innovates
Mots-clésComputer scienceSegmentationImage segmentationArtificial intelligenceNatural language processingSemantics (computer science)Computer visionInformation retrievalProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Segment Anything Model (SAM) is a foundation model that can be prompted with sparse prompts, like boxes or points, and dense prompts such as masks. SAM outputs binary masks based on the given prompts but lacks semantic understanding as it doesn't output the class of the predicted mask. We propose Semantic AutoSAM, a semantic segmentation model that builds upon SAM's binary segmentation. Semantic AutoSAM replaces SAM's manual prompt encoder with a lightweight cross-attention module, enabling it to predict prompt embeddings directly from the image features. This eliminates the need for manual prompting.In our experiments on the FLAIR 2022 dataset (20 CT scans) and a hip ultrasound dataset (4849 2D images), Semantic AutoSAM matches the performance of using groundtruth bounding box prompts for most organs. Our proposed method achieves a Dice score of 0.62 in the FLAIR dataset, and MobileSAM with groundtruth box achieves 0.7. In the hip ultrasound dataset, our approach achieves a Dice score of 0.83, surpassing MobileSAM's slightly lower score of 0.81 despite MobileSAM having access to the groundtruth box for prediction. Notably, our method doesn't require manual prompts at test time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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