<i>Streptococcus pneumoniae</i> Serotype Distribution Among US Adults Hospitalized With Community-Acquired Pneumonia, 2019–2020
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Serotype-specific urinary antigen detection (UAD) assay results can be used to estimate the serotype contribution among adults with pneumococcal community-acquired pneumonia (CAP) and to guide recommendations regarding higher-valency pneumococcal conjugate vaccines (PCVs). Methods Adults aged ≥18 years hospitalized with radiographic evidence of CAP were prospectively enrolled in 4 US cities from November 2019 to December 2020, overlapping the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. Data were collected by patient interview and medical chart review. Streptococcus pneumoniae was isolated from standard-of-care respiratory samples and blood; urine collected per-protocol was tested by S pneumoniae BinaxNOW and UAD assays. The proportions of adults with radiologically confirmed CAP (RAD+ CAP) testing positive for S pneumoniae and for serotypes contained in PCV13, PCV15, and PCV20 were calculated. Results Among 3098 adults enrolled, 2105 (67.9%) had RAD+ CAP. Of these, 44.3% were ≥65 years of age, and most had a chronic medical condition (46.0%) or were immunocompromised (38.5%). Streptococcus pneumoniae was detected by any method in 214 (10.2%) RAD+ CAP participants, including 63 (3.0%) with serotypes covered by PCV13, 81 (3.9%) by PCV15, and 119 (5.7%) by PCV20. Streptococcus pneumoniae and PCV serotype positivity were higher before the pandemic (November 2019–April 2020) compared to during the COVID-19 pandemic (May 2020–December 2020). Conclusions Our study demonstrated that despite the COVID-19 pandemic, PCV serotype pneumococcus continued to cause an important proportion of adult CAP in the US. These data are useful for informing PCV recommendations and for establishing an epidemiologic baseline to assess the impact of such recommendations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».