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Enregistrement W4405494525 · doi:10.1016/j.xjon.2024.12.004

In vivo virulence of Staphylococcus aureus in native versus prosthetic left-sided valve endocarditis

2024· article· en· W4405494525 sur OpenAlexaff
Haytham Elgharably, Jan Claesen, Naseer Sangwan, Muhammad Etiwy, Penny L. Houghtaling, Gary W. Procop, Nabin K. Shrestha, Brian P. Griffin, José Navia, Lars G. Svensson, Daniel J. Wozniak, Gösta Pettersson

Notice bibliographique

RevueJTCVS Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfective Endocarditis Diagnosis and Management
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesLerner Research Institute, Cleveland ClinicCleveland Clinic
Mots-clésVirulenceStaphylococcus aureusMicrobiologyEndocarditisIn vivoInfective endocarditisStaphylococcal infectionsMedicineBiologyBacteriaSurgeryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives Staphylococcus aureus infective endocarditis is commonly associated with invasive pathology and is worse in prosthetic valve endocarditis. In this study, we aim to examine S. aureus virulence and pathological features of native and prosthetic valve infective endocarditis. Methods Between 2002 and 2020, 438 patients underwent surgery for left-sided endocarditis caused by S. aureus at our center (59% native and 41% prosthetic valve endocarditis). Endocarditis registry was queried, and pathological features were based on the echocardiography and operative findings. In addition, vegetation samples were collected from 6 patients undergoing surgery for infective endocarditis (3 native and 3 prosthetic valve endocarditis). Total RNA was extracted from all specimens, and messenger RNA sequencing was executed for transcriptomic analysis. Data were pooled into STAR aligner, and gene expression related to virulence factors was compared between 2 groups. Results Rates of invasive pathology were higher in prosthetic versus native valve infective endocarditis (76% vs 40%, P < .0001), which impacted the complexity of surgical procedures and perioperative course, but not in-hospital mortality. Transcriptomic analysis has shown differences in gene expression between vegetation specimens of native and prosthetic valve endocarditis, including genes for stress response, biofilm formation, and virulence factors. The gene aur (encodes for aureolysin) was highly upregulated in prosthetic valve vegetations compared with native valve vegetations ( P = .023). Conclusions Prosthetic valve endocarditis caused by S. aureus is associated with further invasive pathology compared with native valve endocarditis, which could be related to upregulation of genes responsible for biofilm formation and metalloproteinase production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,480
Score d'incertitude au seuil0,697

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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