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Enregistrement W4405518883 · doi:10.1093/ndt/gfae292

Infiltrative classical monocyte-derived and SPP1 lipid-associated macrophages mediate inflammation and fibrosis in ANCA-associated glomerulonephritis

2024· article· en· W4405518883 sur OpenAlexaff
Yosta Vegting, Aldo Jongejan, Annette E. Neele, Nike Claessen, Gal Sela, Koen H.M. Prange, Jesper Kers, Joris J. T. H. Roelofs, Joost W van der Heijden, Onno J. de Boer, Ester B. M. Remmerswaal, Liffert Vogt, Fréderike J. Bemelman, Menno P.J. de Winther, Perry D. Moerland, Marc Hilhorst

Notice bibliographique

RevueNephrology Dialysis Transplantation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVasculitis and related conditions
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesMinistry of Minority AffairsNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNierstichting
Mots-clésMedicineMacrophageInflammationCD163ImmunologyFibrosisCCL2Kidney diseaseOsteopontinMonocyteGlomerulonephritisPathologyKidneyChemokineBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Kidney macrophage infiltration is a histological hallmark of vasculitic lesions and is strongly linked to disease activity in anti-neutrophil cytoplasmic antibodies (ANCA)-associated glomerulonephritis (AGN). The precise mechanisms by which kidney macrophages influence local inflammation and long-term damage remain largely unknown. METHODS: Here, we investigate kidney macrophage diversity using single-cell transcriptome analysis of 25 485 freshly retrieved unfrozen, high-quality kidney CD45+ immune cells from five AGN patients during active disease, a lupus nephritis and a nephrectomy control. Detailed subclustering of myeloid cells was performed to identify disease-specific macrophage subtypes. Next, transcriptome differences between macrophage subsets and disease serotypes were assessed. Findings were validated by immunostainings of an extended cohort of kidney biopsies and flow cytometric analysis of peripheral blood monocytes. RESULTS: Four main macrophage subsets were identified, including a classical monocyte-derived macrophage (MDM) subset expressing a chemotactic (CXCL2, CXCL3, CXCL8, CCL3) and pro-inflammatory (IL1β, TNF) set of markers and an osteopontin/SPP1+ lipid-associated macrophage (SPP1 LAMs) subtype exhibiting distinctive upregulation of fibrotic genesets. AGN samples revealed a markedly increased proportion of CD163+ macrophages, predominantly composed of classical MDMs, accompanied by resident-like C1Q macrophages, and SPP1 LAMs. An analogous trend was observed in the expansion of peripheral blood classical monocytes during active disease. The proteinase 3 (PR3)-AGN subtype exhibited heightened classical MDM and SPP1 LAM infiltration and markers of acute inflammation, while interferon signaling and markers of chronicity were reduced compared with myeloperoxidase-AGN. CONCLUSIONS: Our findings highlight the expression of inflammatory and fibrotic genes by kidney macrophage subsets in AGN. Classical monocyte dysregulation might contribute to inflammation in the pathogenesis of AGN. Targeting these specific monocyte/macrophage subsets may potentially control the inflammatory cascade and attenuate resulting fibrosis in AGN and kidney disease in general.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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