MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405523294 · doi:10.1038/s41597-024-04261-5

Primate Phenotypes: A Multi-Institution Collection of 3D Morphological Data Housed in MorphoSource

2024· article· en· W4405523294 sur OpenAlexaff
Sergio Almécija, Kelsey D. Pugh, Alisha Anaya, Christopher M. Smith, Nancy B. Simmons, Robert S. Voss, Neil Duncan, Darrin P. Lunde, Megan K. Viera, Teresa Hsu, Emmanuel Gilissen, Stephanie Maiolino, Julie Winchester, Biren A. Patel, Caley M. Orr, Matthew W. Tocheri, Eric Delson, Ashley S. Hammond, Douglas Boyer, Santiago A. Catalano

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2024
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiquePrimate Behavior and Ecology
Établissements canadiensLakehead UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMinisterio de Ciencia e InnovaciónAmerican Museum of Natural HistoryAgencia Estatal de InvestigaciónNational Science Foundation
Mots-clésDigitizationPhenomicsMetadataNatural historyNational Museum of Natural HistoryComputer scienceData scienceWorld Wide WebBiologyEcologyGenomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The field of phenomics is experiencing unprecedented advances thanks to the rapid growth of morphological quantification based on three-dimensional (3D) imaging, online data repositories, team-oriented collaborations, and open data-sharing policies. In line with these progressions, we present an extensive primate phenotypic dataset comprising >6,000 3D scans (media) representing skeletal morphologies of 386 individual specimens covering all hominoid genera (except humans) and other selected primates. The digitized specimens are housed in physical collections at the American Museum of Natural History, the National Museum of Natural History, the Royal Museum for Central Africa (Belgium), the Cleveland Museum of Natural History, and Stony Brook University. Our technical validation indicates that despite the diverse digitizing devices used to produce the scans, the final 3D models (meshes) can be safely combined to collect comparable morphometric data. The entire dataset (and detailed associated metadata) is freely available through MorphoSource. Hence, these data contribute to empowering the future of primate phenomics and providing a roadmap for future digitization and archiving of digital data from other collections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,295
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,161
Tête enseignante GPT0,395
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific DataMême sujetPrimate Behavior and EcologyTravaux en français237 207