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Enregistrement W4405531432 · doi:10.1016/j.mimet.2024.107071

Broth microdilution protocol for determining antimicrobial susceptibility of Legionella pneumophila to clinically relevant antimicrobials

2024· article· en· W4405531432 sur OpenAlex
Max Sewell, Caitlin Farley, Edward Portal, Diane Lindsay, Maria Luisa Ricci, Sophie Jarraud, Maria Scaturro, Ghislaine Descours, Anne Vatland Krøvel, Rachael Barton, Ian Boostom, Roisin Ure, Darja Keše, Valeria Gaia, Matej Golob, Susanne Paukner, Christophe Ginévra, Baharak Afshar, Sendurann Nadarajah, Ingrid Wybo, Charlotte Michel, Fedoua Echahdi, Juana María González-Rubio, Fernando González‐Camacho, M. Mentasti, Anastasia Flountzi, Markus Petzold, Jacob Moran‐Gilad, Søren Anker Uldum, Jonas M. Winchell, Mandy Wooton, Kathryn Bernard, Lucy C. Jones, Victoria J. Chalker, O. Brad Spiller

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Microbiological Methods · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLegionella and Acanthamoeba research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesEuropean Society of Clinical Microbiology and Infectious DiseasesCardiff University
Mots-clésBroth microdilutionAntimicrobialMicrobiologyLegionella pneumophilaMinimum inhibitory concentrationLegionellaBiologyAntibiotic resistanceAntibioticsBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Currently there is no detailed, internationally agreed protocol defined to evaluate antimicrobial susceptibility testing (AST) for Legionella pneumophila (required to establish epidemiological cut-off value or “ECOFF” boundaries); therefore, antimicrobial resistance in these isolates cannot be defined. AST methods utilising media containing activated charcoal as an ingredient, to enable Legionella growth, are unreliable as noted in an internationally authored opinion paper and a new gold standard is required. Here we define a detailed protocol for broth microdilution (BMD) using defined cell culture collection-deposited control reference strains (Philadelphia-1 and Knoxville-1) as well as two accessible reference strains with moderately ( lpeAB -carrying) and markedly (23S rRNA mutation-carrying) elevated azithromycin minimum inhibitory concentration (MIC). The defined protocol enables up to eight L. pneumophila strains to be set up on a single 96-well plate per antimicrobial tested. Initial ranges to routinely capture an MIC for these reference strains using clinically relevant antimicrobials azithromycin (0.01–0.25 mg/L), levofloxacin (0.008–0.03 mg/L), lefamulin (0.01–2 mg/L), rifampicin (0.0002–0.0008 mg/L) and doxycycline (0.25–16 mg/L) following incubation for 48 h at 37 °C in a shaking incubator have been empirically determined. Establishment of this internationally agreed protocol sets the scene for the next step: validation and comparison of antimicrobial ranges between international Legionella reference laboratories to establish putative resistance cut-off thresholds for these clinically relevant antimicrobials. • Internationally agreed microbroth dilution method for Legionella pneumophila AST. • Characterised susceptible and MIC-elevated strains for quality controls identified. • Putative antimicrobial ranges for further multi-site validation proposed. • Optimal conditions for reliable Legionella pneumophila AST defined. • Link to instructional video provided.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,343
Score d'incertitude au seuil0,774

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,466
Écart entre enseignants0,388 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle