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Enregistrement W4405543415 · doi:10.1186/s13567-024-01419-2

Serotype diversity of Actinobacillus pleuropneumoniae detected by real-time PCR in clinical and subclinical samples from Spanish pig farms during 2017–2022

2024· article· en· W4405543415 sur OpenAlexaff
José Luís Arnal, Marcelo Gottschalk, Sonia Lacotoure, Celia Sanz, Gema Chacón Pérez, Desireé Martín-Jurado, A. Fernández

Notice bibliographique

RevueVeterinary Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPleuropneumoniaActinobacillus pleuropneumoniaeSerotypeOutbreakBiologySubclinical infectionActinobacillusHerdVirologyMicrobiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Actinobacillus pleuropneumoniae is the causative agent of porcine pleuropneumonia, a challenging respiratory disease for the global swine industry. Variations in the serotypes associated with clinical disease have been observed in different regions worldwide. This study aimed to provide an updated epidemiological assessment of A. pleuropneumoniae serotypes in Spain, incorporating bacterial characterization through serotyping and toxinotyping. Serotypes 9/11, 2, 4, 5, 17, and 13 were frequently identified in diseased animals. Furthermore, qPCR of lung samples from an outbreak, even when samples were pooled, emerged as a robust diagnostic tool, enabling the rapid detection of A. pleuropneumoniae and their serotypes without the need for microbiological isolation. This technology also facilitates serotype monitoring of apparently healthy herds through the testing of oral fluids. The study revealed the frequent simultaneous presence of diverse serotypes within a farm. Serotypes 1, 7, 10, 12, 18, and 19 were frequently found in subclinically infected animals but were rarely detected in acute pleuropneumonia outbreaks in the current study. These results provide valuable information for interpreting the potential virulence of the different serotypes in Spain. However, other predisposing factors and the immune status of the herds such as type of vaccines used when appropriate, should be carefully considered before drawing definitive conclusions. Nevertheless, the study offers valuable insights that underscore the necessity for detailed regional data to contribute toward a comprehensive understanding of the disease dynamics and toward formulating effective control measures for porcine pleuropneumonia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,889
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,139
Tête enseignante GPT0,398
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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