Serotype diversity of Actinobacillus pleuropneumoniae detected by real-time PCR in clinical and subclinical samples from Spanish pig farms during 2017–2022
Notice bibliographique
Résumé
Actinobacillus pleuropneumoniae is the causative agent of porcine pleuropneumonia, a challenging respiratory disease for the global swine industry. Variations in the serotypes associated with clinical disease have been observed in different regions worldwide. This study aimed to provide an updated epidemiological assessment of A. pleuropneumoniae serotypes in Spain, incorporating bacterial characterization through serotyping and toxinotyping. Serotypes 9/11, 2, 4, 5, 17, and 13 were frequently identified in diseased animals. Furthermore, qPCR of lung samples from an outbreak, even when samples were pooled, emerged as a robust diagnostic tool, enabling the rapid detection of A. pleuropneumoniae and their serotypes without the need for microbiological isolation. This technology also facilitates serotype monitoring of apparently healthy herds through the testing of oral fluids. The study revealed the frequent simultaneous presence of diverse serotypes within a farm. Serotypes 1, 7, 10, 12, 18, and 19 were frequently found in subclinically infected animals but were rarely detected in acute pleuropneumonia outbreaks in the current study. These results provide valuable information for interpreting the potential virulence of the different serotypes in Spain. However, other predisposing factors and the immune status of the herds such as type of vaccines used when appropriate, should be carefully considered before drawing definitive conclusions. Nevertheless, the study offers valuable insights that underscore the necessity for detailed regional data to contribute toward a comprehensive understanding of the disease dynamics and toward formulating effective control measures for porcine pleuropneumonia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».