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Enregistrement W4405565596 · doi:10.3390/jcm13247773

Developing a Computational Phenotype of the Fourth Universal Definition of Myocardial Infarction for Inpatients

2024· article· en· W4405565596 sur OpenAlexafffundabout
Elliot A. Martin, Bryan Har, Robin L. Walker, Danielle A. Southern, Hude Quan, Cathy A. Eastwood

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myocardial Infarction Research
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of CalgaryAlberta Health Services
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicineCohortMyocardial infarctionTroponinInternal medicineCardiologyCohort studyMedical record

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The fourth universal definition of myocardial infarction (MI) introduced the differentiation of acute myocardial injury from MI. In this study, we developed a computational phenotype for distinct identification of acute myocardial injury and MI within electronic medical records (EMRs). Methods: Two cohorts were used from a Calgary-wide EMR system: a chart review of 3042 randomly selected inpatients from Dec 2014 to Jun 2015; and 11,685 episodes of care that included cardiac catheterization from Jan 2013 to Apr 2017. Electrocardiogram (ECG) reports were processed using natural language processing and combined with high-sensitivity troponin lab results to classify patients as having an acute myocardial injury, MI, or neither. Results: For patients with an MI diagnosis, only 64.0% (65.7%) in the catheterized cohorts (chart review cohort) had two troponin measurements within 6 h of each other. For patients with two troponin measurements within 6 h; of those with an MI diagnosis, our phenotype classified 25.2% (31.3%) with an acute myocardial injury and 62.2% (55.2%) with an MI in the catheterized cohort (chart review cohort); and of those without an MI diagnosis, our phenotype classified 12.9% (12.4%) with an acute myocardial injury and 10.0% (13.1%) with an MI in the catheterized cohort (chart review cohort). Conclusions: Patients with two troponin measurements within 6 h, identified by our phenotype as having either an acute myocardial injury or MI, will at least meet the diagnostic criteria for an acute myocardial injury (barring lab errors) and indicate many previously uncaptured cases. Myocardial infarctions are harder to be certain of because ECG report findings might be superseded by evidence not included in our phenotype, or due to errors with the natural language processing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,022
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,022
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,146
Tête enseignante GPT0,442
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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