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Enregistrement W4405574438 · doi:10.1093/pcp/pcae149

Poplar leaf bud resin metabolomics: seasonal profiling of leaf bud chemistry in <i>Populus trichocarpa</i> provides insight into resin biosynthesis

2024· article· en· W4405574438 sur OpenAlexafffund
Eerik‐Mikael Piirtola, David P. Overy, C. Peter Constabel

Notice bibliographique

RevuePlant and Cell Physiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPopulus trichocarpaMetabolomicsChemistryBiosynthesisAnnual growth cycle of grapevinesBotanyHigh-performance liquid chromatographyChromatographyBiochemistryBiologyShootEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Trees in the genus Populus synthesize sticky and fragrant resins to protect dormant leaf buds during winter. These resins contain diverse phenolic metabolites, in particular, hydroxycinnamate esters and methylated flavonoids. Populus trichocarpa leaf bud resin is characterized by methylated dihydrochalcone aglycones. To determine how the resin profile is influenced by seasonal changes, P. trichocarpa lateral leaf bud extracts and secreted surface resin were collected monthly over a 1-year cycle. The dihydrochalcones in both sets of extracts were quantified using ultrahigh pressure liquid chromatography-mass spectrometry (UPLC-MS), and other chemical changes were monitored using nontargeted metabolomics by UPLC-high-resolution MS (UPLC-HRMS). The results indicate that the dihydrochalcone content changes over the seasons and that biosynthesis occurs concomitant with bud development in the summer months. Nontargeted metabolomics data confirmed a pattern of dramatic changes in the summer and further suggested additional periods of substantive biochemical change in the resin. While overall patterns of surface-extracted resin matched those of whole bud extracts, some of the dynamics were shifted in the surface resin samples. This study provides the basis for the use of dihydrochalcones and other identified resin components as metabolic markers for more detailed investigations of resin biosynthesis, secretion, and movement to the bud surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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