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Enregistrement W4405583117 · doi:10.1093/jambio/lxae303

Soil pH modulates the activity of low-affinity methane oxidation in soils from the Amazon region

2024· article· en· W4405583117 sur OpenAlexaff
Leandro Fonseca de Souza, Fernanda Mancini Nakamura, Marie Kroeger, Dasiel Obregón, Moacir Tuzzin de Moraes, Mariana Gomes Vicente, Marcelo Zacharias Moreira, Vivian H. Pellizari, Siu Mui Tsai, Klaus Nüsslein

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoil Carbon and Nitrogen Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloNational Science Foundation
Mots-clésAmazon rainforestSoil waterMethaneAnaerobic oxidation of methaneEnvironmental chemistryChemistryEnvironmental scienceSoil scienceBiologyEcologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: In the Amazon region, pastures are the main land use subsequent to deforestation and this change can result in soil acidification and degradation. Liming is a management practice to increase soil pH, important to recover degraded lands and increase soil fertility, but its impacts on soil methane cycling in tropical soils are unknown. Here we investigate the role of soil pH on methane uptake under high concentrations of the gas, manipulating pasture and forest soils pH by liming and evaluating the active methane cycling microbial community. METHODS AND RESULTS: Top layer of forest and pasture soils were subjected to liming treatment and incubated with ∼10 000 ppm of 13CH4. Soil DNA was evaluated with Stable Isotopic Probing (SIP-DNA), methanotrophic abundance was quantified (pmoA gene), and high throughput sequencing of 16S rRNA was performed. Liming increased the methane uptake in both forest (∼10%) and pasture (∼25%) soils. Methanotrophs Methylocaldum spp. (type I) and potential methanotrophs in Beijerinckiaceae (type II) were identified to actively incorporate carbon from methane in limed pasture soils. In limed forest soils, Nitrososphaeraceae were identified as 13C-enriched taxa, indicating that ammonia oxidizers can oxidize methane in these soils. CONCLUSIONS: Liming Amazonian pasture soils not only contributes to the fertility and recovery of degraded areas but also has the potential to improve the oxidation of methane at high concentrations of this gas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,148

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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