MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405591760 · doi:10.1002/hbm.70082

Subject‐Level Segmentation Precision Weights for Volumetric Studies Involving Label Fusion

2024· article· en· W4405591760 sur OpenAlexfundno aff
C.W. Chen, Sandhitsu R. Das, M. Dylan Tisdall, Fengling Hu, Andrew A. Chen, Paul A. Yushkevich, David A. Wolk, Russell T. Shinohara

Notice bibliographique

RevueHuman Brain Mapping · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMedical Image Segmentation Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNorthern California Institute for Research and EducationNational Institute of Mental HealthPfizerNovartis Pharmaceuticals CorporationUniversity of Southern CaliforniaBiogenEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbBioClinicaU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsNational Institute on AgingAlzheimer's Association
Mots-clésSegmentationWeightingArtificial intelligenceComputer sciencePattern recognition (psychology)NeuroimagingRegion of interestMarket segmentationVolume (thermodynamics)PsychologyMedicineNeuroscienceRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In neuroimaging research, volumetric data contribute valuable information for understanding brain changes during both healthy aging and pathological processes. Extracting these measures from images requires segmenting the regions of interest (ROIs), and many popular methods accomplish this by fusing labels from multiple expert-segmented images called atlases. However, post-segmentation, current practices typically treat each subject's measurement equally without incorporating any information about variation in their segmentation precision. This naïve approach hinders comparing ROI volumes between different samples to identify associations between tissue volume and disease or phenotype. We propose a novel method that estimates the variance of the measured ROI volume for each subject due to the multi-atlas segmentation procedure. We demonstrate in real data that weighting by these estimates markedly improves the power to detect a mean difference in hippocampal volume between controls and subjects with mild cognitive impairment or Alzheimer's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,046
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,079

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,046
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,140
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHuman Brain MappingMême sujetMedical Image Segmentation TechniquesTravaux en français237 207