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Enregistrement W4405596668 · doi:10.1186/s12870-024-05930-8

Identification of two QTLs for web blotch resistance in peanut (Arachis hypogaea L.) based on BSA-seq

2024· article· en· W4405596668 sur OpenAlexaff
Mingbo Zhao, Ziqi Sun, Feiyan Qi, Liu Hua, Stefano Pavan, Liuyang Fu, Juan Wang, Guoquan Chen, Fanke Zeng, Xiaohui Wu, Pengyu Qu, Wenzhao Dong, Zheng Zheng, Xinyou Zhang

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePeanut Plant Research Studies
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesHenan Academy of Agricultural SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyQuantitative trait locusArachis hypogaeaBulked segregant analysisPopulationAgronomyGeneticsGene mappingGeneChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Peanut (Arachis hypogaea L.) is a globally important oilseed and cash crop. Web blotch is one of the most important peanut foliar diseases, causing severe yield losses worldwide. RESULTS: population was used to identify quantitative trait loci (QTLs) for peanut web blotch resistance, based on bulked segregant analysis (BSA). Kompetitive Allele-Specific PCR (KASP) markers were developed and used to further narrow QTL intervals and detect candidate genes. Two major QTLs, qWBRA05 and qWBRA08 were identified, spanning physical intervals of 465.75 Kb and 434.83 Kb, and explaining percentages of phenotypic variation (PVE) of 8.79% and 15.09%, respectively. Moreover, two KASP markers were developed within the QTL interval effectively distinguished between web blotch resistance and web blotch susceptible materials. CONCLUSIONS: The QTLs identified and two molecular markers closely linked to web blotch resistance were developed within the QTL interval, which are potentially valuable in peanut breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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