MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405598358 · doi:10.1002/smtd.202401477

Toward Automated DNA Nanoprinting: Advancing the Synthesis of Covalently Branched DNA

2024· article· en· W4405598358 sur OpenAlexafffund
Fangzhou Zhao, Daniel Saliba, Jathavan Asohan, Hanadi F. Sleiman

Notice bibliographique

RevueSmall Methods · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésDNACovalent bondDNA nanotechnologyTemplateDNA origamiMoleculeNanotechnologySticky and blunt endsChemistryMaterials scienceCombinatorial chemistryBase pairBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Covalently branched DNA molecules are hybrid structures where a small molecule core is covalently linked to different DNA strands. They merge the programmability of DNA nanotechnology with synthetic molecules' functionality, offering enhanced stability over their non-covalent counterparts like double-crossover tiles. They enable the efficient assembly of stable DNA nanostructures with new geometries and functionalities. These motifs can be prepared through "DNA printing", which uses a DNA nanostructure as a temporary template to covalently transfer specific DNA strands to a small molecule core. Here, the "printing" process is streamlined with DNA-immobilized polystyrene microspheres, laying the foundation for future automated DNA printing devices. First, the DNA template hybridizes with reactive complementary strands, which are then crosslinked using a small molecule. Second, beads with fully complementary molecules capture the "daughter" products by strand displacement. This ensures high product yields and high recovery of the "mother" template for reuse. This method allows the precise transfer of different DNA strands onto various small molecules, including aromatics and functional porphyrins. Notably, these branching motifs exhibit remarkable stability toward nucleases without any specialized modifications. Moreover, they can serve as robust building blocks for precise assembly of 3D structures, such as an addressable tetrahedron from only two components.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueSmall MethodsMême sujetAdvanced biosensing and bioanalysis techniquesTravaux en français237 207