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Enregistrement W4405623725 · doi:10.1094/php-05-24-0045-rs

Unveiling the Diversity and Virulence of Seedborne <i>Fusarium</i> Species in Lentil Production: Insights from a Two-Year Study in the Northern Great Plains

2024· article· en· W4405623725 sur OpenAlexaboutno aff
Collins Bugingo, Monica Brelsford, Dimitri Fonseka, Julie S. Pasche, Mary Burrows

Notice bibliographique

RevuePlant Health Progress · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and Agriculture
Mots-clésBiologyVirulenceFusariumDiversity (politics)BotanyAgronomyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium root rot/wilt caused by various Fusarium spp. significantly threatens lentil ( Lens culinaris Medikus) production in the Northern Great Plains (NGP) region. However, the specific composition of seedborne Fusarium spp. causing this disease is not well understood. To address this gap, we conducted a comprehensive study spanning 2019 and 2020, collecting lentil seeds from 75 commercial fields across Montana, North Dakota, Washington, Idaho, and Ontario. Our analysis focused on both externalized and internalized pathogens, with particular attention to Fusarium spp., employing morphological and molecular techniques for identification. In total, 486 and 228 Fusarium isolates were recovered in 2019 and 2020, respectively. Predominant species included F. equiseti, F. acuminatum, F. oxysporum, F. tricinctum, F. graminearum, F. proliferatum, F. redolens, F. avenaceum, and F. sporotrichioides. Virulence studies conducted in the greenhouse revealed varying levels of aggressiveness among Fusarium spp., with F. sporotrichioides, F. oxysporum, and F. graminearum demonstrating the highest virulence. Further investigation into pathogen internalization within seed lots revealed that incidence was highest in the seed coat, followed by the cotyledon, with the lowest occurrence in the embryo. F. avenaceum was prevalently isolated from the seed coat, cotyledon, and embryo. Additionally, Fusarium spp. isolated from the seed coat and cotyledon exhibited higher virulence and greater diversity compared with those from the embryo. This study reports the first comprehensive assessment of both externalized and internalized seedborne Fusarium spp. in the NGP region. The insights gained from our findings will inform the development of targeted management strategies for Fusarium root rot/wilt, ultimately aiding in the preservation of lentil crop health and productivity in the NGP and beyond.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil0,210

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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