Application of a Language Model Tool for COVID-19 Vaccine Adverse Event Monitoring Using Web and Social Media Content: Algorithm Development and Validation Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Spontaneous pharmacovigilance reporting systems are the main data source for signal detection for vaccines. However, there is a large time lag between the occurrence of an adverse event (AE) and the availability for analysis. With global mass COVID-19 vaccination campaigns, social media, and web content, there is an opportunity for real-time, faster monitoring of AEs potentially related to COVID-19 vaccine use. Our work aims to detect AEs from social media to augment those from spontaneous reporting systems. OBJECTIVE: This study aims to monitor AEs shared in social media and online support groups using medical context-aware natural language processing language models. METHODS: We developed a language model-based web app to analyze social media, patient blogs, and forums (from 190 countries in 61 languages) around COVID-19 vaccine-related keywords. Following machine translation to English, lay language safety terms (ie, AEs) were observed using the PubmedBERT-based named-entity recognition model (precision=0.76 and recall=0.82) and mapped to Medical Dictionary for Regulatory Activities (MedDRA) terms using knowledge graphs (MedDRA terminology is an internationally used set of terms relating to medical conditions, medicines, and medical devices that are developed and registered under the auspices of the International Council for Harmonization of Technical Requirements for Pharmaceuticals for Human Use). Weekly and cumulative aggregated AE counts, proportions, and ratios were displayed via visual analytics, such as word clouds. RESULTS: Most AEs were identified in 2021, with fewer in 2022. AEs observed using the web app were consistent with AEs communicated by health authorities shortly before or within the same period. CONCLUSIONS: Monitoring the web and social media provides opportunities to observe AEs that may be related to the use of COVID-19 vaccines. The presented analysis demonstrates the ability to use web content and social media as a data source that could contribute to the early observation of AEs and enhance postmarketing surveillance. It could help to adjust signal detection strategies and communication with external stakeholders, contributing to increased confidence in vaccine safety monitoring.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,020 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».