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Enregistrement W4405664011 · doi:10.1016/j.omtn.2024.102443

Antisense oligonucleotide-mediated exon 27 skipping restores dysferlin function in dysferlinopathy patient-derived muscle cells

2024· article· en· W4405664011 sur OpenAlexafffund
Saeed Anwar, Rohini Roy Roshmi, Stanley Woo, Umme Sabrina Haque, Joshua J. A. Lee, William Duddy, Anne Bigot, Rika Maruyama, Toshifumi Yokota

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy — Nucleic Acids · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMuscular Dystrophy CanadaWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Dentistry, University of AlbertaCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesSorbonne UniversitéInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCanada Foundation for InnovationWashington University in St. LouisUniversity of AlbertaInstitut de MyologieMinistry of Advanced Education, Government of AlbertaWomen and Children's Health Research InstituteChildren's Health Research InstituteMuscular Dystrophy Canada
Mots-clésDysferlinExonOligonucleotideExon skippingFunction (biology)Cell biologyBiologyMolecular biologyChemistryGeneGeneticsAlternative splicing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dysferlinopathies are debilitating autosomal recessive muscular dystrophies caused by mutations in the DYSF gene, encoding dysferlin, a protein crucial for sarcolemmal homeostasis and membrane resealing. Currently, no therapies exist for dysferlinopathies. Dysferlin features a modular structure with multiple calcium-dependent C2 lipid-binding domains. Clinical reports of mild, late-onset phenotypes suggest partial retention of functionality despite missing C2 domains, supporting exon-skipping therapies using antisense oligonucleotides (ASOs). In this study, we identified a patient-derived muscle cell line with a splice site mutation in DYSF intron 26, causing exon 26 exclusion, an out-of-frame transcript, and no detectable dysferlin protein. We hypothesized that skipping DYSF exon 27 could restore the reading frame and membrane repair function. Using an in-house in silico tool, we designed ASOs targeting exon 27. Treatment resulted in 65%–92% exon 27 skipping in myoblasts and myotubes, leading to a 39%–51% rescue of normal dysferlin expression, demonstrating robust efficacy of our designed ASOs. Two-photon laser-based assays indicated functional membrane repair. Additionally, we observed improved myotube fusion, cell vitality, and reduced apoptosis levels post-treatment. These findings provide proof of concept that DYSF exon 27 skipping restores functional dysferlin in patient-derived cells, paving the way for future in vivo and clinical studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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