MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405674510 · doi:10.1016/j.jbc.2024.108118

Dilated cardiomyopathy variant R14del increases phospholamban pentamer stability, blunting dynamic regulation of calcium

2024· article· en· W4405674510 sur OpenAlexafffund
Sean R. Cleary, Allen C. T. Teng, Audrey Deyawe Kongmeneck, Xuan Fang, Taylor A. Phillips, Ellen E. Cho, Rhys A. Smith, Patryk Karkut, Catherine A. Makarewich, Peter M. Kekenes–Huskey, Anthony O. Gramolini, Seth L. Robia

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésPhospholambanPentamerCalciumCardiomyopathyInternal medicineDilated cardiomyopathyChemistryCardiologyEndocrinologyMedicineBiochemistryHeart failure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The sarco(endo)plasmic reticulum Ca 2+ ATPase (SERCA) is a membrane transporter that creates and maintains intracellular Ca 2+ stores. In the heart, SERCA is regulated by an inhibitory interaction with the monomeric form of the transmembrane micropeptide phospholamban (PLB). PLB also forms avid homo-pentamers, and the dynamic exchange of PLB between pentamers and SERCA is an important determinant of cardiac responsiveness to exercise. Here, we investigated two naturally occurring pathogenic variants of PLB: a cysteine substitution of Arg9 (R9C) and an in-frame deletion of Arg14 (R14del). Both variants are associated with dilated cardiomyopathy. We previously showed that the R9C mutation causes disulfide crosslinking and hyperstabilization of pentamers. While the pathogenic mechanism of R14del is unclear, we hypothesized this mutation may also alter pentamer stability. Immunoblots revealed a significantly increased pentamer: monomer ratio for R14del-PLB compared to WT-PLB. We quantified homo-oligomerization and SERCA-binding in live cells using fluorescence resonance energy transfer (FRET) microscopy. R14del-PLB showed an increased affinity for homo-oligomerization and decreased binding affinity for SERCA compared to WT. The data suggest that, like R9C, the R14del mutation stabilizes PLB in pentamers, decreasing its ability to regulate SERCA. The R14del mutation reduced the rate of PLB unbinding from pentamers after transient elevations of Ca 2+ , limiting the recovery of PLB-SERCA complexes. A computational model predicted that hyperstabilization of PLB pentamers by R14del impairs the ability of cardiac Ca 2+ handling to respond to changing heart rates between rest and exercise. We postulate that impaired responsiveness to physiological stress contributes to arrhythmogenesis in human carriers of the R14del mutation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetCardiomyopathy and Myosin StudiesTravaux en français237 207