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Enregistrement W4405676731 · doi:10.1101/2024.12.19.629437

Segregated localization of target-SNARE proteins within presynaptic terminals of Munc18-1 deficient photoreceptors

2024· preprint· en· W4405676731 sur OpenAlexafffund
Mengjia Huang, Chun Hin Chow, Jason Charish, Karen Indrawinata, Hidekiyo Harada, Valerie A. Wallace, Philippe P. Monnier, Shuzo Sugita

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenUniversity of Texas Southwestern Medical Center
Mots-clésExocytosisCell biologySyntaxinBiologySNARE complexSynaptic vesicleVesicular Transport ProteinsMunc-18SynapseNeuroscienceVesicleMembraneVacuoleBiochemistryCytoplasm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Sec1/Munc18 family proteins are essential for SNARE-mediated vesicular exocytosis. However, where SNARE proteins are localized in Munc18-1 deficient presynaptic terminals remains unclear due to the rapid degeneration of neurons lacking Munc18-1. Here, we found that removing Munc18-1 from photoreceptor cells did not result in major cellular loss until postnatal day 14, which allowed us to investigate the role of Munc18-1 in endogenous presynaptic terminals. In the absence of Munc18-1, even before major photoreceptor cell degeneration, functional impairments were present. While Munc18-1 was not required for the pre-synaptic enrichment of the t-SNARE proteins syntaxin-3 and SNAP-25, it played a critical role in their proper localization. In wild-type conditions, t-SNAREs are highly colocalized. However, in the absence of Munc18-1, their distribution becomes strikingly segregated. Immuno-electron microscopy revealed that without Munc18-1, syntaxin-3 is retained within various organelle membranes rather than being targeted to synaptic plasma membranes. These findings provide the first evidence that Munc18-1 is important to prevent segregation of syntaxin-3 and SNAP-25 within presynaptic terminals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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