MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405692631 · doi:10.1186/s13395-024-00368-w

Comparative lipidomic and metabolomic profiling of mdx and severe mdx-apolipoprotein e-null mice

2024· article· en· W4405692631 sur OpenAlexafffund
Ram B. Khattri, Abhinandan Batra, Zoe White, David W. Hammers, Terence E. Ryan, Elisabeth R. Barton, Pascal Bernatchez, Glenn A. Walter

Notice bibliographique

RevueSkeletal Muscle · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesState of FloridaNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesMitacsCanadian Institutes of Health ResearchCanada Foundation for InnovationNational High Magnetic Field LaboratoryMcKnight Foundation
Mots-clésDuchenne muscular dystrophymdx mouseInternal medicineDystrophinEndocrinologyApolipoprotein BApolipoprotein EBiologyTriglycerideLipid metabolismFatty liverCholesterolChemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Despite its notoriously mild phenotype, the dystrophin-deficient mdx mouse is the most common model of Duchenne muscular dystrophy (DMD). By mimicking a human DMD-associated metabolic comorbidity, hyperlipidemia, in mdx mice by inactivating the apolipoprotein E gene ( mdx-ApoE ) we previously reported severe myofiber damage exacerbation via histology with large fibro-fatty infiltrates and phenotype humanization with ambulation dysfunction when fed a cholesterol- and triglyceride-rich Western diet ( mdx-ApoE W ). Herein, we performed comparative lipidomic and metabolomic analyses of muscle, liver and serum samples from mdx and mdx-ApoE W mice using solution and high-resolution-magic angle spinning (HR-MAS) 1 H-NMR spectroscopy. Compared to mdx and regular chow-fed mdx-ApoE mice, we observed an order of magnitude increase in lipid deposition in gastrocnemius muscle of mdx-ApoE W mice including 11-fold elevations in -CH 3 and -CH 2 lipids, along with pronounced elevations in serum cholesterol, fatty acid, triglyceride and phospholipids. Hepatic lipids were also elevated but did not correlate with the extent of muscle lipid infiltration or differences in serum lipids. This study provides the first lipometabolomic signature of severe mdx lesions exacerbated by high circulating lipids and lends credence to claims that the liver, the main regulator of whole-body lipoprotein metabolism, may play only a minor role in this process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueSkeletal MuscleMême sujetMuscle Physiology and DisordersTravaux en français237 207