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Enregistrement W4405702396 · doi:10.1242/bio.060483

Patient-matched tumours, plasma, and cell lines reveal tumour microenvironment- and cell culture-specific microRNAs

2024· article· en· W4405702396 sur OpenAlex
Latasha Ludwig, Emma N. Vanderboon, Heather Treleaven, R. Darren Wood, Courtney R. Schott, Geoffrey A. Wood

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiology Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesOVC Pet TrustNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésmicroRNABiologyOsteosarcomaCell typeCell cultureCancerCellCancer researchTumor microenvironmentComputational biologyRNAGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNA molecules that are present in all cell types and bodily fluids and are commonly dysregulated in cancer. miRNAs in cancer have been studied by measuring levels in cell lines, tumour tissues, and in circulation; however, no study has specifically investigated miRNA expression in patient-matched samples across all three sample types. Canine osteosarcoma is a well-established spontaneously occurring model of human osteosarcoma for which matched samples are available. We analysed a panel of miRNAs by real-time quantitative PCR and compared across patients and sample types. While some miRNAs are highly expressed in all three sample types, tumour tissue and cell lines had the most in common. There were several miRNAs that were highly expressed in plasma and tumour tissue but not in cell lines and likely represent miRNAs produced in the tumour microenvironment. Two highly expressed miRNAs were exclusive to plasma and are known to be expressed in circulating cells. This study highlights the importance of considering sample type when studying miRNAs in cancer and demonstrates the power of using patient-matched samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,201
Score d'incertitude au seuil0,827

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle