Rare Taxa Are Key Links in Regional Antimicrobial Resistance Profiles in Dusts Across Diverse North American Regions
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The role of bioaerosols in the dispersal of antimicrobial resistance genes (ARGs) and resistant microorganisms is poorly understood. In addition, bioaerosols are powerful composite samples representative of the surrounding environment and can be used as sentinels of many local habitats. Evidence suggests that using environmental DNA from dust collected on vehicle cabin air filters can define regional resistance profiles. Here, this method was used to investigate differences in resistance gene profiles, their underlying bacterial communities, and their links to anthropogenic and environmental variables across Canada. In total, 477 car filter samples were collected, with every province and territory being represented. DNA was extracted from filter dust. High‐throughput qPCR was used to detect and quantify a panel of 36 ARGs and 3 mobile genetic elements. Bacterial biomass was assessed using standard qPCR methods of the 16S rRNA gene, which was also used to assess bacterial biodiversity via metabarcoding. Results indicated that qepA dominates antimicrobial resistance profiles across Canada. However, after they were removed from the dataset, regional profiles were evident based on gene type and richness. Factors positively linked to total numbers of ARGs included human and livestock populations; whereas mean annual precipitation was negatively linked to resistance gene quantities. Measures of α‐diversity were generally greater in the western regions of Canada than in the east and the north. Community composition analyses showed similarities between the prairies and territories, which were separated from other regions. Finally, network analyses revealed a relatively stable group of core ARGs across regions, which were largely correlated with low‐abundance genera. Such findings suggest that rare taxa are key links in the diffusion of antimicrobial resistance in environmental contexts. Furthermore, this study highlights the potential application of vehicle air filters in building long‐term monitoring capacity of outdoor bioaerosols.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».