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Enregistrement W4405726347 · doi:10.3390/genes15121637

Genome-Wide Association Analysis of Growth Traits in Hu Sheep

2024· article· en· W4405726347 sur OpenAlexfundno aff
Tingting Li, Xing Feng, Na Zhang, Jieran Chen, Yuting Zhang, Hengqian Yang, Shiyu Peng, Runlin Ma, Qiuyue Liu, Shangquan Gan, Haitao Wang

Notice bibliographique

RevueGenes · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Science and Technology Major ProjectInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesChina Agricultural University
Mots-clésCandidate geneBiologyGenome-wide association studyGenotypingSNP genotypingBreedGeneticsSelective breedingGenetic associationGeneSNPSingle-nucleotide polymorphismBiotechnologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

(1) Background: The Hu sheep is a renowned breed characterized by high reproduction, year-round estrus, and resistance to high humidity and temperature conditions. However, the breed exhibits lower growth rates and meat yields, which necessitate improvements through selective breeding. The integration of molecular markers in sheep breeding programs has the potential to enhance growth performance, reduce breeding cycles, and increase meat production. Currently, the applications of SNP chips for genotyping in conjunction with genome-wide association studies (GWAS) have become a prevalent approach for identifying candidate genes associated with economically significant traits in livestock. (2) Methods: To pinpoint candidate genes influencing growth traits in Hu sheep, we recorded the birth weight, weaning weight, and weights at 3, 4, 5, 6, and 7 months for a total of 567 Hu sheep, and genotyping was performed using the Ovine 40K SNP chip. (3) Results: Through GWAS analysis and KEGG pathway enrichment, we identified three candidate genes associated with birth weight (CAMK2B, CACNA2D1, and CACNA1C). Additionally, we found two candidate genes linked to weaning weight (FGF9 and BMPR1B), with CACNA2D1 also serving as a shared gene between birth weight and weaning weight traits. Furthermore, we identified eight candidate genes related to monthly weight (FIGF, WT1, KCNIP4, JAK2, WWP1, PLCL1, GPRIN3, and CCSER1). (4) Conclusion: Our findings revealed a total of 13 candidate genetic markers that can be utilized for molecular marker-assisted selection, aiming to improve meat production in sheep breeding programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,399
Score d'incertitude au seuil0,346

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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