Cost-effectiveness of targeted next-generation sequencing (tNGS) for detection of tuberculosis drug resistance in India, South Africa and Georgia: a modeling analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background: Targeted next-generation sequencing (tNGS) is promising alternative to phenotypic drug susceptibility testing (pDST) for detecting drug-resistant tuberculosis (DRTB). This study explored the potential cost-effectiveness of tNGS for the diagnosis of DR-TB across 3 settings: India, South Africa and Georgia. Methods: To inform WHO guideline development group (GDG) on tNGS we developed a stochastic decision analysis model and assessed cost-effectiveness of tNGS for DST among rifampicin resistance individuals. We also assessed tNGS as initial test for TB drug resistance in bacteriologically confirmed TB. Diagnostic accuracy and cost data were sourced from a systematic review conducted for GDG, covering studies published until September 2022. The primary outcome was incremental cost (2021 US$) per disability-adjusted life year (DALY) averted. Findings: tNGS when compared with in-country DST, tNGS proved cost-effective in South Africa (ICER: $15,619/DALY averted, WTP: $21,165) but not in Georgia (ICER: $18,375/DALY averted, WTP: $15,069). In India, tNGS dominated in-country DST practice, providing greater health impact at lower cost. When comparing tNGS with universal pDST, tNGS was dominated by pDST in all three countries. In Georgia, using tNGS as initial test for TB drug-resistance compared to Xpert MTB/Rif followed by pDST appeared cost-effective. Scenario with 50% reduction in tNGS test kit costs made tNGS cost-effective across all three countries, while a high Bedaquiline resistance prevalence (30%) led to a worsening cost-effectiveness. Interpretation: tNGS may be cost-effective in India, South Africa and Georgia when comprehensive DST is not routinely performed. Thus, existing DST practice and healthcare infrastructure should be considered before implementation and scale-up of tNGS. Funding: Global Tuberculosis Program, World Health Organization (2022/1249364-0).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,007 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».