MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405736543 · doi:10.1111/eva.70055

Genomic Evidence for the Purging of Deleterious Genetic Variation in the Endangered North Atlantic Right Whale

2024· article· en· W4405736543 sur OpenAlexafffund
Richard W. Orton, Philip K. Hamilton, Timothy R. Frasier

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Applications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine animal studies overview
Établissements canadiensSaint Mary's University
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaResearch Nova ScotiaGenome AtlanticGenome Canada
Mots-clésBiologyInbreedingGenetic diversityGenetic loadPopulationEffective population sizeRuns of HomozygosityGenetic driftEvolutionary biologyGenetic variationPopulation bottleneckFounder effectEndangered speciesMutation AccumulationInbreeding depressionGeneticsMutation rateAlleleEcologyDemographyMicrosatelliteGeneGenotypeHaplotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The reduced genetic diversity and frequent inbreeding associated with small population size may underpin the accumulation and expression of deleterious mutations (mutation load) in some declining populations. However, demographic perturbations and inbreeding coupled with purifying selection can also purge declining populations of deleterious mutations, leading to intriguing recoveries. To better understand the links between deleterious genetic variation and population status, we assess patterns of genetic diversity, inbreeding, and mutation load across the genomes of three species of Balaenidae whale with different demographic histories and recoveries following the end of commercial whaling in the 1980s. Unlike bowhead (BH) and Southern right whales (SRW), which show signs of recent recovery, reproductive rates of the endangered North Atlantic right whale (NARW) remain lower than expected. We show that the NARW is currently marked by low genetic diversity, historical inbreeding, and a high mutation load. Still, we reveal evidence that genetic purging has reduced the frequency of highly deleterious alleles in NARW, which could increase chances of future population recovery. We also identify a suite of mutations putatively linked to congenital defects that occur at high frequencies in nulliparous NARW females but are rare in NARW with high reproductive success. These same mutations are nearly absent in BH and SRW in this study, suggesting that the purging of key variants may shape the probability of population recovery. As anthropogenic disturbances continue to reduce the sizes of many populations in nature, resolving the links between population dynamics and mutation load could become increasingly important.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,148
Score d'incertitude au seuil0,284

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEvolutionary ApplicationsMême sujetMarine animal studies overviewTravaux en français237 207