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Enregistrement W4405776443 · doi:10.1101/2024.12.20.629794

Texture-Analysis Classification of Intraductal Carcinoma of the Prostate Using Label-Free Multimodal Nonlinear Optical Imaging

2024· preprint· en· W4405776443 sur OpenAlexaff
Jacob Gagnon, Christian H. Allen, Mame-Kany Diop, F. Dallaire, Frédéric Leblond, Dominique Trudel, Sangeeta Murugkar

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensPolytechnique MontréalUniversité de MontréalCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTexture (cosmology)Nonlinear systemArtificial intelligenceComputer sciencePattern recognition (psychology)PhysicsImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intraductal carcinoma of the prostate (IDC-P) is a very aggressive histopathological subtype of prostate cancer (PCa) for which no accurate biomarkers exist. In our work, we apply a multimodal nonlinear optical imaging approach that uses second-harmonic generation (SHG) and stimulated Raman scattering (SRS) imaging to distinguish IDC-P from regular PCa and benign prostate tissue. Images from each tissue type were classified using support vector machine (SVM). The technique classified the images from each region based on first-order statistics and texture-based second-order statistics derived from the gray-level co-occurrence matrix (GLCM) of the images. Our results demonstrate that SVM models trained on either SHG or SRS images accurately classify IDC-P as well as high-grade PCa, low-grade PCa, and benign tissue with a mean classification accuracy of over 89%. Furthermore, a classification model combining both SHG and SRS imaging modalities can accurately classify all tissue types with a mean classification accuracy of 98%.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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