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Enregistrement W4405825076 · doi:10.1038/s41392-024-02077-8

Itaconate facilitates viral infection via alkylating GDI2 and retaining Rab GTPase on the membrane

2024· article· en· W4405825076 sur OpenAlexaff
Shulei Yin, Yijie Tao, Tianliang Li, Chunzhen Li, Yani Cui, Yunyan Zhang, Shenhui Yin, Liyuan Zhao, Panpan Hu, Likun Cui, Yunyang Wu, Yixian He, Shu Yan Yu, Jie Chen, Shaoteng Lu, Guifang Qiu, Mengqi Song, Qianshan Hou, Qian Cheng, Zui Zou, Sheng Xu, Yizhi Yu

Notice bibliographique

RevueSignal Transduction and Targeted Therapy · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaScience and Technology Commission of Shanghai MunicipalityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésRabGTPaseBiologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metabolic reprogramming of host cells plays critical roles during viral infection. Itaconate, a metabolite produced from cis-aconitate in the tricarboxylic acid cycle (TCA) by immune responsive gene 1 (IRG1), is involved in regulating innate immune response and pathogen infection. However, its involvement in viral infection and underlying mechanisms remain incompletely understood. Here, we demonstrate that the IRG1-itaconate axis facilitates the infections of VSV and IAV in macrophages and epithelial cells via Rab GTPases redistribution. Mechanistically, itaconate promotes the retention of Rab GTPases on the membrane via directly alkylating Rab GDP dissociation inhibitor beta (GDI2), the latter of which extracts Rab GTPases from the membrane to the cytoplasm. Multiple alkylated residues by itaconate, including cysteines 203, 335, and 414 on GDI2, were found to be important during viral infection. Additionally, this effect of itaconate needs an adequate distribution of Rab GTPases on the membrane, which relies on Rab geranylgeranyl transferase (GGTase-II)-mediated geranylgeranylation of Rab GTPases. The single-cell RNA sequencing data revealed high expression of IRG1 primarily in neutrophils during viral infection. Co-cultured and in vivo animal experiments demonstrated that itaconate produced by neutrophils plays a dominant role in promoting viral infection. Overall, our study reveals that neutrophils-derived itaconate facilitates viral infection via redistribution of Rab GTPases, suggesting potential targets for antiviral therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,676

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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