MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405825632 · doi:10.1101/2024.12.26.630018

A Thermo-responsive collapse system for controlling heterogeneous cell localization, ratio and interaction for three-dimensional solid tumor modeling

2024· preprint· en· W4405825632 sur OpenAlexaff
Yu Li, Jordan S. Orange

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésMaterials scienceBiophysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

models, however, poses a challenge to mechanistic studies attempting to approve existing approaches of effector cell-mediated cytotoxicity within a three-dimensional, solid tumor-like environment. To gain additional experimental control, we developed an approach for constructing three-dimensional (3D) culture models using smart polymers that form temperature responsive hydrogels. By embedding cells in these hydrogels, we constructed 3D models to organize multiple cell populations at specified ratios on-demand and gently position them by exploiting the hydrogel phase transition. These systems were amenable to imaging at low- and high-resolution to evaluate cell-to-cell interactions, as well as to dissociation to allow for single cell analyses. We have called this approach "thermal collapse of strata" (TheCOS) and demonstrated its use in creating complex cell assemblies on demand in both layers and spheroids. As an application, we utilized TheCOS to evaluate the impact of directionality of degranulation of natural killer (NK) cell lytic granules. Blocking lytic granule convergence and polarization by inhibiting dynein has been shown to induce bystander killing in single cell suspensions. Using TheCOS we showed that lytic granule dispersion induced by dynein inhibition can be sustained in 3D and results in a multi-directional killing including that of non-triggering bystander cells. By imaging TheCOS experiments, we were able to map a "kill zone" associated with multi-directional degranulation in simulated solid tumor environments. TheCOS should allow for the testing of approaches to alter the mechanics of cytotoxicity as well as to generate a wide-array of human tumor microenvironments to assist in the acceleration of tumor immunotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujet3D Printing in Biomedical ResearchTravaux en français237 207