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Enregistrement W4405826962 · doi:10.1016/j.jncc.2024.10.002

The global progress and quality assessment of research on the association between circulating tumor DNA and clinical prognosis: a systematic review

2024· review· en· W4405826962 sur OpenAlexaboutno aff
Meng Zhang, Xiaowei Chen, Qingxin Zhou, Nana Guo, Baoshan Cao, Hongmei Zeng, Wanqing Chen, Feng Sun

Notice bibliographique

RevueJournal of the National Cancer Center · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésQuality (philosophy)Association (psychology)Quality assessmentMedicineOncologyInternal medicineComputational biologyCancer researchPsychologyExternal quality assessmentBiologyPathologyEpistemologyPsychotherapistPhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Circulating tumor DNA (ctDNA) has shown potential as a prognostic biomarker in patients with solid tumors. This study aimed to systematically summarize the global application of ctDNA in the prognostic management of solid tumor patients and to evaluate the quality of the current studies. Methods: PubMed, Web of Science, Embase, Cochrane Library, Scopus, and clinical trials.gov databases were searched to collect cohort studies on ctDNA in the prognosis of solid tumor patients from January 2016 to May 2022. The language was limited to English. Information including general information, participants and cancer characteristics, ctDNA and outcome information were extracted. The quality of the studies was assessed using the Newcastle-Ottawa Scale checklist. Results: A total of 214 studies were included in the final analysis, encompassing 21,076 patients. The number of studies has increased annually from 2016 to 2022. The most common types of solid tumors studied were colorectal cancer (27.10 %), lung cancer (20.09 %), pancreatic cancer (16.82 %), and breast cancer (14.02 %). The top three journals by number of publications had an impact factor in 2023 greater than 10. Of the studies, the median sample size was 69 (interquartile range: 41-111), 69.81 % had a sample size <100, 68.92 % had a median/mean age ≥60 years, and 74.05 % were from developed countries. Multi-center studies accounted for 40.36 %. Additionally, 29.82 % of the studies had a bias risk score ≤6. Only 16.67 % of studies on liver cancer had a bias risk score >6. The primary criteria not met by the studies included "Adequacy of follow-up of cohorts" (33.33 %), "Assessment of outcome" (32.16 %) and "Representativeness of the exposed cohort" (27.49 %). Conclusions: The prognostic value of ctDNA in patients with solid tumors is gaining increasing attention, leading to a steady rise in the number of studies. However, many studies still suffer from small sample sizes and a lack of representativeness. Furthermore, details regarding ctDNA detection methods and results reporting are often insufficiently described. There is an urgent need to improve the quality of such research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,323
Score d'incertitude au seuil0,309

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,217
Tête enseignante GPT0,547
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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