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Enregistrement W4405827541

Toward a unified approach to modeling adaptation among demographers and evolutionary ecologists: Evo-Demo Hyperstate Matrix Population Model

2024· preprint· en· W4405827541 sur OpenAlexaff
Joanie Van de Walle, Jimmy Garnier, Timothée Bonnet, Stéphanie Jenouvrier

Notice bibliographique

RevueHAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAnimal Ecology and Behavior Studies
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesNatural Environment Research CouncilNational Science Foundation
Mots-clésAdaptation (eye)Computer scienceManagement scienceEcologyBiologyEconomicsNeuroscience
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1.Demographic and evolutionary modeling approaches are critical to understanding and projecting species responses to global environmental changes. Population matrix models have been a favored tool in demography, but until recently, they failed to account for short-term evolutionary changes. Evolutionary-explicit demographic models remain computationally intensive, difficult to use, and have yet to be widely adopted for empirical studies. Researchers focusing on short-term evolution often favor individual-based simulations, which are more flexible but less transferable and computationally efficient. Limited communication between fields has led to differing perspectives on key issues, such as how life-history traits affect adaptation to environmental change.2.We develop a new Evo-Demo Hyperstate Matrix Population Model (EvoDemo-Hyper MPM) that incorporates the genetic inheritance of quantitative traits, enabling fast computation of evolutionary and demographic dynamics. We evaluate EvoDemo-Hyper MPM against individual-based simulations and provide analytical approximations for adaptation rates across six distinct scales in response to selection. We show that different methods yield equivalent results for the same biological scenario, although semantic differences between fields may obscure these similarities.3.Our results demonstrate that EvoDemo-Hyper MPM provides accurate, computationally efficient solutions, closely matching outcomes from individual-based simulations and analytical approximations under similar biological conditions. Adaptation rates per generation remain constant across species when selection acts on fertility but vary with other vital rates. Adaptation per time decreases with generation time unless selection targets adult survival, where intermediate life histories adapt fastest. Rates per generation, defined as the relative change in individual fitness, remain constant across species and vital rates. 4.We discuss that no general prediction emerges about which species or life-history traits yield higher adaptation rates, as outcomes depend on life cycles, vital rates, and the definition used. We provide Matlab and R code to support the application of our EvoDemo-Hyper MPM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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