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Enregistrement W4405851957 · doi:10.5376/gab.2024.15.0021

Research on Chloroplast Genome Variation and Phylogenetic Relationships in Camellia sinensis

2024· article· en· W4405851957 sur OpenAlexvenueno aff
Chen Lian, Chuchu Liu

Notice bibliographique

RevueGenomics and Applied Biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Species Descriptions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCamellia sinensisPhylogenetic treeBiologyGenomeEvolutionary biologyChloroplastVariation (astronomy)PhylogeneticsPhylogenetic relationshipBotanyGeneticsGenePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study explores the chloroplast genome variation and phylogenetic relationships in Camellia sinensis . As a globally important economic crop, understanding the genome structure of tea is crucial for its breeding and improvement. Research on the chloroplast genome provides key insights into species evolution, especially regarding the classification and domestication of tea varieties. By collecting samples from representative Camellia sinensis cultivars and utilizing high-throughput sequencing techniques and bioinformatics tools, this study analyzes genetic variations in the chloroplast genome, such as SNPs and indels, and constructs phylogenetic trees to demonstrate the relationships between different cultivars. The results reveal that chloroplast genome variation correlates with the geographic distribution and phenotypic traits of tea, making it a potential marker for tea breeding and conservation. This research not only enhances our understanding of the chloroplast genome in Camellia sinensis but also provides valuable references for the genetic improvement and development of the tea industry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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