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Enregistrement W4405854006 · doi:10.1111/ene.70025

From spastic paraplegia to infantile neurodegenerative disorder: Expanding the phenotypic spectrum associated with biallelic <scp><i>SPAST</i></scp> variants

2024· article· en· W4405854006 sur OpenAlexafffund
Manon Degoutin, Chloé Angelini, Claire Bar, Wahiba Amer El Khedoud, Christine Barnérias, Razika Boulariah‐Hadjou, Mehrdad A. Estiar, Claire Ewenczyk, Ziv Gan‐Or, Didier Lacombe, Claire Lefeuvre, Purvi Majethia, Mouna Messaoud‐Khelifi, Dhanya Lakshmi Narayanan, Guy A. Rouleau, Oksana Suchowersky, Anju Shukla, Marine Guillaud‐Bataille, Cyril Goizet

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neurology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensUniversity of AlbertaMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésHereditary spastic paraplegiaMedicineExome sequencingSanger sequencingGenetic heterogeneityCompound heterozygosityGeneticsSpastic quadriplegiaPhenotypePediatricsBioinformaticsMutationGeneBiologyPhysical medicine and rehabilitation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Heterozygous pathogenic variants in SPAST are known to cause Hereditary Spastic Paraplegia 4 (SPG4), the most common form of HSP, characterized by progressive bilateral lower limbs spasticity with frequent sphincter disorders. However, there are very few descriptions in the literature of patients carrying biallelic variants in SPAST. METHODS: Targeted Sanger sequencing, panel sequencing and exome sequencing were used to identify the genetic causes in 9 patients from 6 unrelated families with symptoms of HSP or infantile neurodegenerative disorder. RESULTS: We describe 5 patients with pure HSP with a variable age of onset, mostly in infancy, and 4 patients with profound intellectual disability and progressively worsening tetrapyramidal syndrome. The patients' parents, heterozygous carriers of pathogenic SPAST variants, included both asymptomatic carriers and patients with classic forms of SPG4. CONCLUSION: Biallelic variants of SPAST may explain cases of hereditary spastic paraplegia with autosomal recessive inheritance. Furthermore, some biallelic variants may also cause psychomotor regression with an infantile neurodegenerative disorder, associated with a tetrapyramidal syndrome, a new phenotype associated with the SPAST gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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