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Enregistrement W4405886406 · doi:10.1094/pdis-04-24-0745-fe

Streamlining Global Germplasm Exchange: Integrating Scientific Rigor and Common Sense to Exclude Phantom Agents from Regulation

2024· article· en· W4405886406 sur OpenAlexaff
Ioannis E. Tzanetakis, Vicken Aknadibossian, Josef Špak, Fiona Constable, S. J. Harper, John Hammond, Thierry Candresse, Svetlana Y. Folimonova, Juliana Freitas‐Astúa, Marc Fuchs, W. Jelkmann, Varvara I. Maliogka, Armelle Marais, Robert R. Martín, Dimitre Mollov, Georgios Vidalakis, Nina Aboughanem‐Sabanadzovic, Maher Al Rwahnih, Olufemi J. Alabi, D. Alioto, Habeeb Yinka Atanda, Ferenc Bagi, V. K. Baranwal, C. J. Barbosa, M. Bar‐Joseph, L. Batista Le Riverend, Tim Beliën, María José Benítez-Galeano, Harvinder Bennypaul, Assunta Bertaccini, Rachelle Bester, Arnaud G. Blouin, Dag‐Ragnar Blystad, Marleen Botermans, Orhan Bozan, Ajay Brakta, Y. Brans, A. Bulajić, A. Catara, E. Choueiri, M. Cieślińska, Glynnis Cook, Weier Cui, John da Graça, Salvatore Davino, Catia Delmiglio, Megan M. Dewdney, Francesco Di Serio, Alfredo Díaz-Lara, M. Digiaro, K. Djelouah, Yafeng Dong, Nerida J. Donovan, Tobiasz Druciarek, N. Durán-Vila, Eminur Elçi, Arnaldo Esquivel‐Fariña, M Fall, Xudong Fan, J. Figueroa, Nicola Fiore, A. Fowkes, Adrian Fox, Jana Fráňová, René Fuchs, Yahya Z. A. Gaafar, María Laura García, Dilip K. Ghosh, Eduardo Augusto Girardi, Miroslav Glasa, Andreas Gratz, Dilyara Gritsenko, Subhas Hajeri, Mohammad Hajizadeh, Zhibo Hamborg, Thiện Hồ, Maria C. Holeva, Somnath K. Holkar, M. Horner, Oscar P. Hurtado‐Gonzales, Antonio Ippolito, V. Isac, Toru Iwanami, Alba Estela Jofre-y-Garfias, R. Jordan, Nikolaos I. Katis, Igor Koloniuk, H. Konings, Ivana Križanac, Robert R. Krueger, A.M. Kyrychenko, F. F. Laranjeira, Irene Lavagi-Craddock, Amit Levy, Grazia Licciardello, Qing‐Yi Lu, Stuart A. MacFarlane, Carmine Marcone, Hans J. Maree, Paolo Margaria, A. Martić, Sébastien Massart, Matthaios M. Mathioudakis, Slavica Matić, Irena Mavrič Pleško, E.T.M. Meekes, Nataša Mehle, Michael J. Melzer, Baozhong Meng, W. Menzel, Vanja Miljanić, A. Minafra, Maria Minutolo, A.K. Mitra, Pedro Moreno, Luís Navarro, Beatriz Navarro, Luca Nerva, A. Okić, Antonio Olmos, N. Önelge, Bolaji Osundahunsi, M. F. Palacios, Vicente Pallás, Stefano Panno, Z. Perez‐Egusquiza, Bindu Poudel, Sebastjan Radišek, Pedro Luis Ramos‐González, Pramod W. Ramteke, Nar B. Ranabhat, Mark Paul Selda Rivarez, Fernando Rivas, Annelien Roenhorst, Avijit Roy, Ana Belén Ruiz-García, Sead Sabanadzovic, Dana Šafářová, Pasquale Saldarelli, N. Salem, G. Sanahuja Solsona, R. Schoen, Susheel Kumar Sharma, Turksen Shilts, Andrea Sierra Mejía, Shivani Singh, A. Skelton, Dijana Škorić, Daisy Stainton, Nataša Štajner, Mira Starović, Eduardo Sanches Stuchi, P. Svoboda, Rachid Tahzima, Joe Tang, M. Tessitori, Jean-Pierre Thermoz, Erin M. Thompson, Jeremy R. Thompson, Piotr Trębicki, Massimo Turina, Çiğdem Ulubaş Serçe, J. Umble, D. Valiūnas, Éva Várallyay, Astha Varma, C. Varveri, Ubilfrido Vásquez Gutiérrez, Inés Vázquez-Iglesias, S. Veerakone, D. E. V. Villamor, M. C. Vives, Darko Vončina, Jinbo Wang, Marcel Westenberg, Thierry Wetzel, Stephan Winter, George W. Wright, Nelson Arno Wulff, Wénxìng Xú, R. K. Yokomi, Chunyun Zhou, Kerstin Zikeli, Jelena Zindović

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect behavior and control techniques
Établissements canadiensLinnaeus Plant Sciences (Canada)University of GuelphUniversité de SherbrookeAgriculture and Agri-Food CanadaCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGermplasmBiologyComputational biologyImaging phantomBiotechnologyBotanyMedicineNuclear medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This collaborative work by over 180 researchers from 40+ countries addresses the challenges posed by "phantom agents"-putative pathogenic agents named in literature without supporting data on their existence. Those agents remain on regulatory lists, creating barriers in trade and plant certification. Historically identified based solely on symptoms, these agents lack isolates or sequence data, making reliable detection or risk assessment impossible. After reviewing over 120 such agents across 10 key plant genera, we recommend their removal from regulatory lists and call for revised standards aligned with modern diagnostics. This effort seeks to streamline germplasm exchange, benefiting global agriculture by removing the constraints imposed by phantoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,336
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,305
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,336
Score d'incertitude au seuil0,819

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3360,305
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0080,004
Études des sciences et des technologies0,0070,014
Communication savante0,0220,020
Science ouverte0,0070,030
Intégrité de la recherche0,0060,011
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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