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Enregistrement W4405893539 · doi:10.1001/jamanetworkopen.2024.52158

Breast Cancer Susceptibility Gene Sequence Variations and Development of Contralateral Breast Cancer

2024· article· en· W4405893539 sur OpenAlexaff
Anne S. Reiner, Gordon P. Watt, Kathleen E. Malone, Charles F. Lynch, Esther M. John, Julia A. Knight, Meghan Woods, Xiaolin Liang, Marc Tischkowitz, David V. Conti, Mark E. Robson, Lene Mellemkjær, Sharon N. Teraoka, Patrick Concannon, Jonine L. Bernstein

Notice bibliographique

RevueJAMA Network Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésBreast cancerCHEK2MedicineCancerOncologyInternal medicineCancer registryPenetrancePopulationEstrogen receptorEpidemiologyGermline mutationGynecologyBiologyGeneticsMutationGenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Importance: Heterogeneity in development of estrogen receptor (ER)-specific first primary breast cancer exists due to deleterious germline variants in moderate- to high-penetrance breast cancer susceptibility genes, but it is unknown if these associations occur in ER-specific CBC. Objective: To determine the association of deleterious germline variants in breast cancer susceptibility genes with ER-specific CBC development and whether ER status of the first primary breast cancer modifies these associations. Design, Setting, and Participants: This case-control study included CBC cases and matched unilateral breast cancer controls from The Women's Environment, Cancer, and Radiation Epidemiology (WECARE) Study, a population-based case-control study. Eligible women were diagnosed between 1985 and 2000 with data and biospecimens collected from 2001 to 2004. Eligible participants were women younger than 55 years at first invasive breast cancer diagnosis. Participants were matched on age, diagnosis year, cancer registry region, and race and ethnicity, and countermatched on radiation treatment. For cases, CBC occurred 1 year or more following first breast cancer diagnosis. Analyses were performed from May to October 2024. Exposures: CHEK2 1100delC and deleterious variants in ATM, BRCA1, and BRCA2. Main Outcome and Measure: Development of CBC, measured as a rate ratio (RR). Results: A total of 1290 women were included in analysis (median [IQR] age at first diagnosis, 47 [42-51] years). The ER-positive CBC rate for women with deleterious ATM variants was 4 times higher than for women without deleterious ATM variants (RR, 4.84; 95% CI, 1.11-21.08; P = .04); no women with ER-negative CBC carried deleterious ATM variants. The ER-positive CBC rates for women with deleterious variants in BRCA2 or CHEK2 1100delC were 5 to 6 times higher than for women without deleterious variants in BRCA2 or CHEK2 1100delC, respectively (BRCA2: RR, 5.88; 95% CI, 2.61-13.26, P < .001; CHEK2 1100delC: RR, 6.06; 95% CI, 1.26-29.04; P = .02). The ER-negative CBC rate for women with deleterious BRCA1 variants was 26 times higher than for women without deleterious BRCA1 variants (RR, 26.16; 95% CI, 8.01-85.44; P < .001). First primary breast cancer ER status did not modify associations between deleterious variants and ER-specific CBC development. Conclusions and Relevance: In this case-control study of CBC, deleterious variants in breast cancer susceptibility genes were differentially associated with ER-specific CBC development. Germline variation profile may inform estimates of outcomes for ER-specific CBC subtypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,704
Score d'incertitude au seuil0,554

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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