Whole-genome evaluation of genetic rescue: the case of a curiously isolated and endangered butterfly
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Genetic rescue, or the translocation of individuals among populations to augment gene flow, can help ameliorate inbreeding depression and loss of adaptive potential in small and isolated populations. Genetic rescue is currently under consideration for an endangered butterfly in Canada, the half-moon hairstreak ( Satyrium semiluna ). A small, unique population persists in Waterton Lakes National Park, Alberta, isolated from other populations by >350km. However, whether genetic rescue would actually be helpful has not been evaluated. Here, we generate the first chromosome-level genome assembly and whole-genome resequence data for the species. We find that the Alberta population’s genetic diversity is extremely low and very divergent from the nearest populations in British Columbia and Montana. Runs of homozygosity suggest this is due to a long history of inbreeding, and coalescent analyses show that the population has been small and isolated, yet stable for up to 40k years. When a population maintains its viability despite inbreeding and low genetic diversity, it has likely undergone purging of deleterious recessive alleles and could be threatened by their reintroduction via genetic rescue. Ecological niche modelling indicates that the Alberta population also exhibits environmental associations that are atypical of the species. Together, these results suggest that population crosses are likely to result in outbreeding depression. We infer that, in this case, genetic rescue has a relatively unique potential to be harmful rather than helpful at present. However, due to reduced adaptive potential, the Alberta may still benefit from future genetic rescue as climate conditions change. Proactive experimental population crosses should be completed to assess reproductive compatibility and offspring fitness.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».